RNA–Protein interactions for RNA: YHR181W

SVP26, Transcript of Integral membrane protein of the early Golgi apparatus and ER, yeast

Gene SVP26, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SVP26	YHR181W	SIC1	P38634	284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	NRG1	Q03125	231 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	KTR4	P38131	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	YBR259W	P38338	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	SUN4	P53616	420 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	ORC4	P54791	529 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	GUD1	Q07729	489 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	THI73	Q07904	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	TGL5	Q12043	749 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	MNN4	P36044	1178 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	MUP1	P50276	574 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	PCL10	P53124	433 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	YBP2	P53169	641 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	KIN4	Q01919	800 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	DLT1	Q04216	342 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	PUS9	Q12069	462 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SVP26	YHR181W	MET3	P08536	511 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
SVP26	YHR181W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	MSE1	P48525	536 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	ARP4	P80428	489 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	CKB2	P38930	258 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	ECM1	P39715	212 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	ELO3	P40319	345 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	AIM21	P40563	679 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	YJR096W	P47137	282 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	AMA1	P50082	593 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	YBR053C	P38235	358 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	SUL1	P38359	859 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	YHR112C	P38716	378 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	YIR042C	P40586	236 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	PMT3	P47190	753 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	RNT1	Q02555	471 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	UME1	Q03010	460 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	FRE5	Q08908	694 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	DCS2	Q12123	353 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	ALG7	P07286	448 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	UBP12	P39538	1254 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	GPG1	P53130	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	YGL081W	P53156	320 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	GAD1	Q04792	585 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	CHS7	P38843	316 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	GID8	P40208	455 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	SLI1	P53304	468 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	ADY4	Q05955	493 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	MCM21	Q06675	368 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	HOS4	P40480	1083 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	BAP3	P41815	604 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	YGR237C	P50089	785 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	NUP145	P49687	1317 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SVP26	YHR181W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	APN2	P38207	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	TDA3	P38758	523 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	RET2	P43621	546 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	YJL163C	P46996	555 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	MTL1	P53214	551 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	REC102	Q02721	264 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	HFD1	Q04458	532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	GRX4	P32642	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	APT2	P36973	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	PPS1	P38148	807 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	MAL31	P38156	614 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	YHR202W	P38887	602 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	LYS9	P38999	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	BEM4	P39011	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	CTF4	Q01454	927 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	IRC13	Q08630	104 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SVP26	YHR181W	PNS1	Q12412	539 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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