RNA–Protein interactions for RNA: YHR060W

VMA22, Transcript of Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function, yeast

Gene VMA22, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA22	YHR060W	YJL045W	P47052	634 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	ASK10	P48361	1146 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	INP52	P50942	1183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	TAD1	P53065	400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	TEP1	P53916	434 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SPS1	P08458	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	HOP1	P20050	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	DAL7	P21826	554 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	LIP5	P32875	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SEG2	P34250	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	OAF3	P36023	863 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YKL151C	P36059	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YKR075C	P36155	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	CCZ1	P38273	704 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	HXT7	P39004	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RRT14	P40470	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YKE2	P52553	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SRT1	Q03175	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SAM35	P14693	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SEC65	P29478	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	BEM3	P32873	1128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	XRS2	P33301	854 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	ZIP2	P53061	704 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	BI4	P03879	638 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	MRP7	P12687	371 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	TAF5	P38129	798 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	ESL1	P40456	1118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	VTC2	P43585	828 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	ENV11	P53246	860 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	TIM50	Q02776	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SSY1	Q03770	852 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	HIM1	Q06674	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	OSW2	Q12202	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	ARP7	Q12406	477 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
VMA22	YHR060W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	OPI1	P21957	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	PHO3	P24031	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SWI3	P32591	825 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	PEX5	P35056	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	YKR018C	P36114	725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	PTC7	P38797	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	PIK1	P39104	1066 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SMK1	P41808	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	HXT16	P47185	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	ORC3	P54790	616 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	HLR1	Q04429	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	NUR1	Q12066	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	PSF3	Q12146	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	ENT1	Q12518	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	PRC1	P00729	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SLC1	P33333	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	YKL050C	P35736	922 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	GIC1	P38785	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	ERR3	P42222	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	CTH1	P47976	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	PUS2	P53167	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	MEP3	P53390	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SDH1	Q00711	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	CRR1	Q05790	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	RSC58	Q07979	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	RSB1	Q08417	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	MIH1	P23748	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	PXA2	P34230	853 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	STL1	P39932	569 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	YIL092W	P40497	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	GTS1	P40956	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	PCL10	P53124	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	SNF5	P18480	905 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA22	YHR060W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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