RNA–Protein interactions for RNA: YGR102C

GTF1, Transcript of Subunit of the trimeric GatFAB AmidoTransferase(AdT) complex, yeast

Gene GTF1, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTF1	YGR102C	YGR021W	P53212	290 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	VPS62	P53285	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	ATG16	Q03818	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	YAP6	Q03935	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	TMA10	Q06177	86 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	NKP1	Q12493	238 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	ENT1	Q12518	454 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	EDE1	P34216	1381 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	PIF1	P07271	859 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	HMI1	Q12039	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	NYV1	Q12255	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	RAV1	P47104	1357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	GCN2	P15442	1659 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	CDC9	P04819	755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	IES5	P40060	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	PEA2	P40091	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	ALG2	P43636	503 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	TRE2	Q08693	809 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	PLC1	P32383	869 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	MND2	P40577	368 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	PEX14	P53112	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	MET13	P53128	600 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	COG8	Q04632	607 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	TPO1	Q07824	586 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	ADE8	P04161	214 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
GTF1	YGR102C	SRD1	P09007	221 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	PCL2	P25693	308 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	SPC29	P33419	253 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	TAF5	P38129	798 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	YAP1801	P38856	637 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	NPP2	P39997	493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	LCD1	Q04377	747 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	MDM38	Q08179	573 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	MPD2	Q99316	277 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	ENA1	P13587	1091 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	SFL1	P20134	766 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	MTC2	P34246	357 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	ESL2	P36168	1195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	CAF16	P43569	289 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	PIP2	P52960	996 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	YNL034W	P53963	612 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	YNL018C	P53976	612 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	UBX4	P54730	416 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	OSW2	Q12202	724 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	RAD18	P10862	487 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	PPH3	P32345	308 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	YRO2	P38079	344 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	GIC1	P38785	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	PLB1	P39105	664 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	ERP2	P39704	215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	YJR096W	P47137	282 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	PHO23	P50947	330 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	ADY3	Q07732	790 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	RAD9	P14737	1309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	HCM1	P25364	564 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	AFR1	P33304	620 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	CKB2	P38930	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	TOK1	P40310	691 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	MET14	Q02196	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	ATP25	Q03153	612 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	SRT1	Q03175	343 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	CDA1	Q06702	301 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	STE11	P23561	717 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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