RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-222ENST00000635152 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.52■□□□□ 0.08
BRF1-222ENST00000635152 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.52■□□□□ 0.08
BRF1-222ENST00000635152 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.52■□□□□ 0.08
BRF1-222ENST00000635152 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.52■□□□□ 0.08
BRF1-222ENST00000635152 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa15.52■□□□□ 0.08
BRF1-222ENST00000635152 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.52■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 CHST3Q7LGC8 479 aa15.52■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 GTF3C6Q969F1 213 aa15.52■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.52■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 CCDC39Q9UFE4 941 aa15.52■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 GORABQ5T7V8 394 aa15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 GLI3P10071 1580 aa15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 SYNE4Q8N205 404 aa15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 ABCC6O95255 1503 aa15.51■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 LIG1P18858 919 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 H3BQV1 296 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 ADORA1P30542 326 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 SCRN1Q12765 414 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 IFFO2Q5TF58 517 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 SPATA32Q96LK8 384 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 ADCY5O95622 1261 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 GPTP24298 496 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 APOBRQ0VD83 1088 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 SH3TC1Q8TE82 1336 aa15.5■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.49■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 TCIRG1Q13488 830 aa15.49■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.49■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.49■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.49■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 MAST3O60307 1309 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 OFD1O75665 1012 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 WASHC4Q2M389 1173 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 PIGBQ92521 554 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 GPR108Q9NPR9 543 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 PI16Q6UXB8 463 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 DACT1Q9NYF0 836 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.48■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 M0R2C6 588 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 OSBP2Q969R2 916 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 PALLDQ8WX93 1383 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 E7EWF7 191 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 HAND2P61296 217 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 UVSSAQ2YD98 709 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 XAGE2Q96GT9 111 aa15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 SCARF1Q14162 830 aa15.46■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.46■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.46■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
BRF1-222ENST00000635152 CIAO1O76071 339 aa15.46■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 HLFQ16534 295 aa15.46■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 BICD2Q8TD16 824 aa15.46■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 BTG4Q9NY30 223 aa15.46■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 KDM4AO75164 1064 aa15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 CCDC192P0DO97 292 aa15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 GUCY1B3Q02153 619 aa15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 ATG3Q9NT62 314 aa15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 MAP3K11Q16584 847 aa15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 ELP1O95163 1332 aa15.44■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 PTPDC1A2A3K4 754 aa15.44■□□□□ 0.06
BRF1-222ENST00000635152 STARD3NLO95772 234 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms