RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa18.16■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 SZT2Q5T011 3432 aa18.16■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 C6orf229H3BNL8 230 aa18.15■□□□□ 0.5
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CS-230ENST00000551968 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CS-230ENST00000551968 TM4SF4P48230 202 aa18.13■□□□□ 0.49
CS-230ENST00000551968 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CS-230ENST00000551968 CFAP53Q96M91 514 aa18.13■□□□□ 0.49
CS-230ENST00000551968 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
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CS-230ENST00000551968 ERBB4Q15303 1308 aa18.13■□□□□ 0.49
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CS-230ENST00000551968 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
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CS-230ENST00000551968 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
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CS-230ENST00000551968 TCIRG1Q13488 830 aa18.09■□□□□ 0.49
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CS-230ENST00000551968 NECTIN2Q92692 538 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-230ENST00000551968 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CS-230ENST00000551968 EN2P19622 333 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CS-230ENST00000551968 PPP2R1AP30153 589 aa18.08■□□□□ 0.48
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CS-230ENST00000551968 ZNF609O15014 1411 aa18.07■□□□□ 0.48
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CS-230ENST00000551968 EYA3Q99504 573 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-230ENST00000551968 TRIM17Q9Y577 477 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-230ENST00000551968 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
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CS-230ENST00000551968 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
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CS-230ENST00000551968 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-230ENST00000551968 OTOP1Q7RTM1 612 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-230ENST00000551968 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
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CS-230ENST00000551968 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CS-230ENST00000551968 AGBL3Q8NEM8 1001 aa18.05■□□□□ 0.48
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CS-230ENST00000551968 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
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CS-230ENST00000551968 UFL1O94874 794 aa18.04■□□□□ 0.48
CS-230ENST00000551968 PRKG1Q13976 671 aa18.04■□□□□ 0.48
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CS-230ENST00000551968 USP17L8P0C7I0 530 aa18.03■□□□□ 0.48
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CS-230ENST00000551968 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.03■□□□□ 0.48
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CS-230ENST00000551968 RPS8P62241 208 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
CS-230ENST00000551968 SREBF2Q12772 1141 aa18.02■□□□□ 0.48
CS-230ENST00000551968 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.02■□□□□ 0.48
CS-230ENST00000551968 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
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CS-230ENST00000551968 SPRYD7Q5W111 196 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 G3V3G9 751 aa18■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 DCAF8Q5TAQ9 597 aa18■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 CD99L2Q8TCZ2 262 aa18■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 CEP290O15078 2479 aa18■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 LAMB1P07942 1786 aa17.99■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 LDLRAD1Q5T700 205 aa17.99■□□□□ 0.47
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CS-230ENST00000551968 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa17.99■□□□□ 0.47
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CS-230ENST00000551968 WNT10BO00744 389 aa17.98■□□□□ 0.47
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CS-230ENST00000551968 IFNL1Q8IU54 200 aa17.98■□□□□ 0.47
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CS-230ENST00000551968 H0YGN5 161 aa17.97■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 USP17L1Q7RTZ2 530 aa17.97■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.97■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 DLL1O00548 723 aa17.96■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.96■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CS-230ENST00000551968 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.96■□□□□ 0.46
CS-230ENST00000551968 DACT2Q5SW24 774 aa17.95■□□□□ 0.46
CS-230ENST00000551968 ARMC9Q7Z3E5 817 aa17.95■□□□□ 0.46
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