RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468069.1

RPS6KC1-203, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KC1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-203ENST00000468069 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 POTEAQ6S8J7 498 aa9.02□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 SYT9Q86SS6 491 aa9.02□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 CEP63Q96MT8 703 aa9.02□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.02□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.02□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.02□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 KIF3BO15066 747 aa9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 ITGB2P05107 769 aa9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 NEUROD1Q13562 356 aa9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 ELOA3Q8NG57 546 aa9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 HINFPQ9BQA5 517 aa9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.01□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 MTUS2Q5JR59 1369 aa9□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 C21orf2O43822 256 aa9□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 HIF1AQ16665 826 aa9□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 ANKLE2Q86XL3 938 aa9□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 HSH2DQ96JZ2 352 aa9□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 SUSD3Q96L08 255 aa9□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 BRD7Q9NPI1 651 aa9□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 SIN3BO75182 1162 aa8.99□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.99□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.99□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 CPS1P31327 1500 aa8.99□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.99□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 PROCP04070 461 aa8.98□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 PTK7Q13308 1070 aa8.98□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.98□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC30A3Q99726 388 aa8.98□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.98□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.98□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 SPEM2Q0P670 501 aa8.97□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 DPYDQ12882 1025 aa8.97□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 NGLY1Q96IV0 654 aa8.97□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.96□□□□□ -0.97
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAM196BA6NMK8 535 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 KCNQ4P56696 695 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 MBD5Q9P267 1494 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 ALKQ9UM73 1620 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L15C9J2P7 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L10C9JJH3 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L12C9JPN9 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L11C9JVI0 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L21D6R901 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L18D6R9N7 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L22D6RA61 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L19D6RCP7 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L20D6RJB6 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 TYRO3Q06418 890 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP17L24Q0WX57 530 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 TNFRSF25Q93038 417 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 PLVAPQ9BX97 442 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 MIA2Q96PC5 1412 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 PZPP20742 1482 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 TIAM1Q13009 1591 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.94□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.94□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 MDFIQ99750 246 aa8.94□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.94□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.94□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.94□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.93□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.93□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 LGR5O75473 907 aa8.93□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 IGFBP4P22692 258 aa8.93□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 RTN1Q16799 776 aa8.93□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 TRIM11Q96F44 468 aa8.93□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.93□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.92□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 NLRP1Q9C000 1473 aa8.92□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 BAG6P46379 1132 aa8.92□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 BHMTQ93088 406 aa8.92□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 MED14O60244 1454 aa8.91□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.91□□□□□ -0.98
RPS6KC1-203ENST00000468069 M0R082 166 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms