RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa24.94■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Greb1lB9EJV3 1913 aa24.94■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jmjd4Q8BFT6 427 aa24.94■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc173A0JLY1 547 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prl7a2O54831 253 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc4a1P04919 929 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Babam1Q3UI43 333 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ZwintQ9CQU5 252 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcmtd1P59913 357 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igflr1Q3U4N7 345 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd23Q812A3 306 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PdcQ9QW08 244 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sytl4Q9R0Q1 673 aa24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myh7Q91Z83 1935 aa24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pde4dQ01063 747 aa24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clca2Q8BG22 942 aa24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spata31d1bE9QA57 1361 aa24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MetP16056 1379 aa24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kndc1Q0KK55 1742 aa24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fer1l6E0CZ42 1862 aa24.91■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfml1Q8BSH2 233 aa24.91■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rassf8Q8CJ96 419 aa24.91■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp19a1P28649 503 aa24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnnm3Q32NY4 713 aa24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb1Q91VL9 713 aa24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp4r3bQ922R5 820 aa24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Iffo2Q8R2V2 512 aa24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plcd1Q8R3B1 756 aa24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sh3bp5Q9Z131 463 aa24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ssc5dQ8BV57 1371 aa24.89■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nwd2Q6P5U7 1742 aa24.89■■□□□ 1.58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TnksQ6PFX9 1320 aa24.89■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21985Q6P6P5 1106 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lmbrd2Q8C561 694 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GptQ8QZR5 496 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TrdnE9Q9K5 693 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ush1cQ9ES64 910 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AidaQ8C4Q6 305 aa24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Srgap1Q91Z69 1062 aa24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BcanQ61361 883 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 R3hcc1Q8BSI6 488 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pm20d1Q8C165 503 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BrapQ99MP8 591 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt85Q9Z2T6 507 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl34A2AI76 644 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ftl2P49945 183 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp8a2P98200 1148 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ano1Q8BHY3 960 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Limch1Q3UH68 1057 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Anp32cQ64G17 123 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atad2Q8CDM1 1040 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TsksO54887 585 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tom1O88746 492 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrp5Q91VN0 1614 aa24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myh1Q5SX40 1942 aa24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cfap73J3QPZ5 306 aa24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psrc1Q9D0P7 329 aa24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Becn1O88597 448 aa24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CgnP59242 1191 aa24.83■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ncaph2Q8BSP2 607 aa24.83■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam84aQ9D650 292 aa24.83■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc162pQ0VG85 912 aa24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pank2Q3U4S0 443 aa24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubash3aQ3V3E1 624 aa24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zkscan8Q8BSL0 588 aa24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cops6O88545 324 aa24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr182P43142 395 aa24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam160b2Q80YR2 744 aa24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem67Q8BR76 992 aa24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp317Q8C0Q5 607 aa24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pms1Q8K119 917 aa24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnq5Q9JK45 933 aa24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hap1O35668 628 aa24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 107.3 ms