RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wdhd1P59328 1117 aa27.8■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa27.8■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp8a2P98200 1148 aa27.8■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ErfeQ6PGN1 340 aa27.8■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam102bQ8BQS4 339 aa27.79■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zkscan8Q8BSL0 588 aa27.79■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 St5Q924W7 1134 aa27.78■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 DbnlQ62418 436 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc39a11Q8BWY7 342 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plekho1Q9JIY0 408 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lgr5Q9Z1P4 907 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ambra1A2AH22 1300 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ifit2Q64112 472 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Strip1Q8C079 837 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plcd4Q8K3R3 807 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Emilin1Q99K41 1017 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Timm10P62073 90 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 IncenpQ9WU62 880 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm7347D3YYI9 267 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ube4aE9Q735 1028 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Speer4aF8VPX6 267 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Popdc2Q9ES82 367 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gsdma2Q32M21 443 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 St18Q80TY4 1045 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 1700029H14RikE9PY36 240 aa27.74■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa27.74■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plbd2Q3TCN2 594 aa27.74■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zbtb45Q52KG4 520 aa27.74■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ubxn10Q8BG34 277 aa27.74■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sh3bp5Q9Z131 463 aa27.74■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nphp3Q7TNH6 1325 aa27.74■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zdhhc9P59268 364 aa27.73■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plekhf1Q3TB82 279 aa27.73■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa27.73■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bcl11aQ9QYE3 773 aa27.73■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 1700006A11RikB9EHI3 544 aa27.73■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rasa1E9PYG6 1038 aa27.73■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf609Q8BZ47 1413 aa27.72■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm45015A0A140LII9 184 aa27.72■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm18336A0A140LIU8 765 aa27.72■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pde8bE9Q4S1 865 aa27.71■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gjb2Q00977 226 aa27.71■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adarb2Q9JI20 745 aa27.71■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf496Q5SXI5 585 aa27.71■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cchcr1Q8K2I2 770 aa27.71■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem143Q8VD26 458 aa27.71■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 StrcQ8VIM6 1809 aa27.71■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rps8P62242 208 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fbxo3Q9DC63 480 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trpc5Q9QX29 975 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Col3a1P08121 1464 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Col4a5Q63ZW6 1691 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myo3bQ1EG27 1305 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kcnb2A6H8H5 907 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CpvlQ9D3S9 478 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Asap2Q7SIG6 958 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sgsm2Q80U12 1005 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SnrkQ8VDU5 748 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gdpd2Q9ESM6 539 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp2b3Q0VF55 1220 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Naa16Q9DBB4 864 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Map3k15A2AQW0 1331 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Oas2E9Q9A9 742 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mctp2Q5RJH2 878 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ak2Q9WTP6 239 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc4a1P04919 929 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp6v0a2P15920 856 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gja5Q01231 358 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Heg1E9Q7X6 1337 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MecomP14404 1042 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tti2Q8BGV4 512 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cfap44E9Q5M6 1843 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TsksO54887 585 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ImpactO55091 318 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GabrdP22933 449 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Psd3Q2PFD7 1037 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem266Q8BZB3 538 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bmp2kQ91Z96 1138 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccne2Q9Z238 404 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spryd3E9Q9B3 442 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mdm2P23804 489 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 IntuQ059U7 942 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rnf20Q5DTM8 973 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HlfQ8BW74 295 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dydc2Q9D3X8 139 aa27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.3 ms