RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Limch1Q3UH68 1057 aa26.04■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ZyxQ62523 564 aa26.04■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abca15E9PWH4 1668 aa26.03■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 R3hcc1Q8BSI6 488 aa26.03■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nrbp1Q99J45 535 aa26.03■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa26.03■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa26.02■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ints5Q8CHT3 1018 aa26.02■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cspp1B2RX88 1205 aa26.02■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp142G5E869 1843 aa26.01■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm21985Q6P6P5 1106 aa26.01■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa26.01■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cwc25Q9DBF7 416 aa26.01■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa26.01■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AtrnQ9WU60 1428 aa26■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nucb2P81117 420 aa26■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Grpel1Q99LP6 217 aa26■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stard3nlQ9DCI3 235 aa26■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2d34L7N463 504 aa25.99■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plcd3Q8K2J0 785 aa25.99■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AK157302I3ITR1 129 aa25.99■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myd88P22366 296 aa25.99■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gpatch11Q3UFS4 262 aa25.99■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pms1Q8K119 917 aa25.99■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Isca1Q9D924 129 aa25.99■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col22a1E9Q7P1 1613 aa25.99■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cfap58B2RW38 873 aa25.98■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif3aP28741 701 aa25.98■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa25.98■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zpr1Q62384 459 aa25.98■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam102bQ8BQS4 339 aa25.98■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sos2Q02384 1333 aa25.98■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TrdnE9Q9K5 693 aa25.97■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdhb15Q91Y04 786 aa25.97■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igflr1Q3U4N7 345 aa25.97■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Txnrd1Q9JMH6 613 aa25.97■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eya2O08575 532 aa25.96■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rgs9O54828 675 aa25.96■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ano6Q6P9J9 911 aa25.96■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krt25Q8VCW2 446 aa25.96■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc4a1P04919 929 aa25.96■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fsd1Q7TPM6 496 aa25.96■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aox4Q3TYQ9 1336 aa25.96■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prl3d2F6R3P9 224 aa25.95■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col18a1P39061 1774 aa25.95■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa25.95■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttc19Q8CC21 365 aa25.95■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mtmr3Q8K296 1196 aa25.95■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Asap2Q7SIG6 958 aa25.94■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tsen34Q8BMZ5 316 aa25.94■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BrapQ99MP8 591 aa25.94■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hmgn5Q9JL35 406 aa25.94■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tpd52l1O54818 204 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hand2Q61039 217 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem67Q8BR76 992 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AidaQ8C4Q6 305 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Osbpl5Q9ER64 874 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adam1aQ60813 791 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spty2d1Q68FG3 682 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abca3Q8R420 1704 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rufy2Q8R4C2 606 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim59Q922Y2 403 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gsdma2Q32M21 443 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem109Q3UBX0 243 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atad2Q8CDM1 1040 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MsnP26041 577 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shisa4Q8CA71 197 aa25.91■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rdm1Q9CQK3 281 aa25.91■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 IncenpQ9WU62 880 aa25.91■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa25.91■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc112A0AUP1 442 aa25.91■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc82Q6PG04 518 aa25.91■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hook1Q8BIL5 728 aa25.91■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plekhd1B2RPU2 505 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Oas2E9Q9A9 742 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Amigo3Q8C2S7 508 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam213aQ9CYH2 218 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Syt10Q9R0N4 523 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smc4Q8CG47 1286 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnq3Q8K3F6 873 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem266Q8BZB3 538 aa25.89■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Alg3Q8K2A8 438 aa25.89■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms