RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF786Q8N393 782 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4D11Q8NGI4 311 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6X1Q8NH79 312 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF224Q9NZL3 707 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC7A7Q9UM01 511 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SVEP1Q4LDE5 3571 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNF1AP20823 631 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD247P20963 164 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EVX1P49640 407 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZP4Q12836 540 aa22.58■■□□□ 1.21
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL17RELQ6ZVW7 336 aa22.58■■□□□ 1.21
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10A6Q8NH74 314 aa22.58■■□□□ 1.21
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAMM41Q96BW9 452 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NANSQ9NR45 359 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS2R5Q9NYW4 299 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLTPQ9NZD2 209 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXL3Q9UKT7 428 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRP5LA4QPB2 252 aa22.57■■□□□ 1.2
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF13O43567 381 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNGR3O43761 229 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THBS2P35442 1172 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLRXP35754 106 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHN2P52757 468 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALK2Q01415 458 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPP4Q96JB8 637 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC19A3Q9BZV2 496 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPK1Q9H3S4 243 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF229Q9UJW7 825 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0G2JND7 137 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EDF1O60869 148 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST1H2ABP04908 130 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TACSTD2P09758 323 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSMPQ1L6U9 139 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDXQ7Z353 690 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SKA3Q8IX90 412 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC17Q8N6Y2 441 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST1H2ACQ93077 130 aa22.56■■□□□ 1.2
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX7Q9BT81 388 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHAC1Q9H158 963 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0R233 179 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENTPD5O75356 428 aa22.55■■□□□ 1.2
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS23P62266 143 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MELKQ14680 651 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB39AQ14964 217 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VMACQ2NL98 169 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL21CQ5VZV1 264 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A24Q8N4F4 322 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASSF5Q8WWW0 418 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF426Q9BUY5 554 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A5Q9H3V2 200 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REV1Q9UBZ9 1251 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LILRA1O75019 489 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PATE4P0C8F1 98 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UMPSP11172 480 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APEX1P27695 318 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIN1Q13671 783 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC80Q76M96 950 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HPS1Q92902 700 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX18Q96RF0 628 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYT3Q9BQG1 590 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYNX1G3V0Z9 82 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINA5P05154 406 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASAH2BP0C7U1 165 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8G3PP0DMU2 310 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYNX1P0DP58 116 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GZMMP51124 257 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FXNQ16595 210 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRFN4Q6PJG9 635 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGFBP3Q8TAT2 258 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS27Q9BQR3 290 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM38BQ9NVV0 291 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC7A8Q9UHI5 535 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBP2O00757 339 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHHO43323 396 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL10O95999 233 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGA4P0DJD7 388 aa22.52■■□□□ 1.2
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