RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W MDM12Q92328 271 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W YOR093CQ12275 1648 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SBP1P10080 294 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W HOM2P13663 365 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W OPI1P21957 404 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SEO1P39709 593 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W EMW1P42842 904 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ASK10P48361 1146 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ALG11P53954 548 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W PPN1Q04119 674 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MLH2Q07980 695 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W GET3Q12154 354 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W PTC5Q12511 572 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W YLL067CQ07888 1374 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W GDB1Q06625 1536 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W CDC26P14724 124 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SAM2P19358 384 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W RPB10P22139 70 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W FUN30P31380 1131 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W DAL1P32375 460 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SSO1P32867 290 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W EMC3P36039 253 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W PGM2P37012 569 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W CCL1P37366 393 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SPO22P40511 975 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SSY1Q03770 852 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W RCO1Q04779 684 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W YML053CQ04978 212 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W NSE1Q07913 336 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SGO1Q08490 590 aa2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
YML039WYML039W CYC8P14922 966 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W RPC31P17890 251 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SIR1P21691 654 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W UIP5P36137 443 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SEC28P40509 296 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W CNN1P43618 361 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W PRP43P53131 767 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W TAM41P53230 385 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ESA1Q08649 445 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W YDL206WQ12424 762 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ADE3P07245 946 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W TIF1P10081 395 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SRM1P21827 482 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ERG6P25087 383 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MBP1P39678 833 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W RLP7P40693 322 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W CCT7P42943 550 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W YET2Q04210 160 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W THI20Q08224 551 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W LCB4Q12246 624 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SLY1P22213 666 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ADY2P25613 283 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MGM1P32266 881 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W NUD1P32336 851 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ISM1P48526 1002 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W VID30P53076 958 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W NNF2P53253 936 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ALD6P54115 500 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MFM1Q02783 413 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ATP25Q03153 612 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W FMP25Q08023 583 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SLP1Q12232 587 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ILV1P00927 576 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SST2P11972 698 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W POL3P15436 1097 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MCM3P24279 971 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W DOM34P33309 386 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W RIM11P38615 370 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W AIM21P40563 679 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data2.79□□□□□ -1.96not detected
YML039WYML039W INP52P50942 1183 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W BNI4P53858 892 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MLC2Q06580 163 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W PDR12Q02785 1511 aa2.79□□□□□ -1.96
YML039WYML039W HXK1P04806 485 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W HAP2P06774 265 aa2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W KAR3P17119 729 aa2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W RAM1P22007 431 aa2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W DUR3P33413 735 aa2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MIA40P36046 403 aa2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W MAP2P38174 421 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W YBP1P38315 674 aa2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W TSC10P38342 320 aa2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W SIP3P38717 1229 aa2.78□□□□□ -1.96
YML039WYML039W YAP1801P38856 637 aa2.78□□□□□ -1.96
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