RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W LAS17Q12446 633 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W BPT1P14772 1559 aa6.33□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W RPD3P32561 433 aa6.33□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W GRX7P38068 203 aa6.33□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W KTR4P38131 464 aa6.33□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W HDA1P53973 706 aa6.33□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W ENV7Q12003 364 aa6.33□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W UBP6P43593 499 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W PUS2P53167 370 aa6.32□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W SLI1P53304 468 aa6.32□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W NOG2P53742 486 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W PEX19Q07418 342 aa6.32□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W GGA2P38817 585 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W NUP82P40368 713 aa6.31□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W HUL5P53119 910 aa6.31□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W FLC1Q08967 793 aa6.31□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W SWM1Q12379 170 aa6.31□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W TAF8Q03750 510 aa6.3□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W PHO8P11491 566 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W SEC21P32074 935 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W YEN1P40028 759 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W BUL1P48524 976 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W DAM1P53267 343 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W TRM11Q12463 433 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W TOM70P07213 617 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W TOP3P13099 656 aa6.28□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W ERG4P25340 473 aa6.28□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W CYS3P31373 394 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W EMC3P36039 253 aa6.28□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W YHR078WP38799 552 aa6.28□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W YLR040CQ07988 224 aa6.28□□□□□ -1.4
YKR104WYKR104W TIM23P32897 222 aa6.27□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W OAR1P35731 278 aa6.27□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W SUL1P38359 859 aa6.27□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W UBP12P39538 1254 aa6.27□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W RNT1Q02555 471 aa6.27□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W YLR125WQ12138 136 aa6.27□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W GAL11P19659 1081 aa6.26□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W CTF13P35203 478 aa6.26□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W CRP1P38845 465 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W REH1Q06709 432 aa6.26□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W YOL073CQ08232 322 aa6.26□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W RAD53P22216 821 aa6.25□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data6.25□□□□□ -1.41not detected
YKR104WYKR104W RSP5P39940 809 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W DUS1P53759 423 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W MDG1P53885 366 aa6.25□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W ERG5P54781 538 aa6.25□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W SSK2P53599 1579 aa6.25□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W TUB3P09734 445 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W KAR1P11927 433 aa6.24□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W DAL7P21826 554 aa6.24□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W THI4P32318 326 aa6.24□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W NGG1P32494 702 aa6.24□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W ALG2P43636 503 aa6.24□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W CAN1P04817 590 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W MET3P08536 511 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W SEC6P32844 805 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W MOH1P38191 138 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W YDR514CQ04408 483 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W YDL121CQ07541 149 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W PPM2Q08282 695 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W HAL9Q12180 1030 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W SIN3P22579 1536 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W PRC1P00729 532 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W BET3P36149 193 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W PZF1P39933 429 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W GYP8P43570 497 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W ASI2P53895 289 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W PKH1Q03407 766 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W DLT1Q04216 342 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W OMS1Q06668 471 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W TAD3Q9URQ3 322 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR104WYKR104W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W SAP190P36123 1033 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W RPP1P38786 293 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W VHR1P40522 640 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W UBA2P52488 636 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W TAD1P53065 400 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W YOR022CQ12204 715 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W ALG7P07286 448 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W TIM44Q01852 431 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W ATP25Q03153 612 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W RSC3Q06639 885 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W ACF2Q12168 779 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W MRC1P25588 1096 aa6.19□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W SET5P38890 526 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W ELO3P40319 345 aa6.19□□□□□ -1.42
YKR104WYKR104W RTA1P53047 317 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.7 ms