RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W YDL121CQ07541 149 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YOR022CQ12204 715 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W PTP2P29461 750 aa5.64□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W RIM4P38741 713 aa5.64□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W PTC7P38797 343 aa5.64□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W SLD3P53135 668 aa5.64□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W SKY1Q03656 742 aa5.64□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YPR027CQ12079 277 aa5.64□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W COX11P19516 300 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W KCC4P25389 1037 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YKL133CP36066 463 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W HXT6P39003 570 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W HXT7P39004 570 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W EMP65P40085 556 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YPL277CQ08989 487 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W Q0142Q9ZZW4 58 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W HSF1P10961 833 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W POA1P38218 177 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W IES5P40060 125 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YFL066CP43538 392 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W RSC8P43609 557 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W BFA1P47113 574 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W BNA2P47125 453 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W ENV11P53246 860 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W RSM24Q03976 319 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W MLC2Q06580 163 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W THI21Q08975 551 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W HFI1Q12060 488 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W HAL9Q12180 1030 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W NSI1Q12457 570 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YLR149CQ99296 730 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W COQ2P32378 372 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W OAF3P36023 863 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W SAF1P38352 637 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W ZIP2P53061 704 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W MSC2Q03455 724 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W CDA1Q06702 301 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YDR215CQ12240 137 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W HCA4P20448 770 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YKU70P32807 602 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W SER1P33330 395 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W MNN4P36044 1178 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YKR018CP36114 725 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W TAT1P38085 619 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W FLR1P38124 548 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W MAL31P38156 614 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W ZRG8P40021 1076 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YGR012WP53206 393 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W DUS1P53759 423 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W NSG2P53898 299 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W SSY1Q03770 852 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W PEX15Q08215 383 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W APM4Q99186 491 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W PFK1P16861 987 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W SEC65P29478 273 aa5.59□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W MRS6P32864 603 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W PTH2P34222 208 aa5.59□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W YKL222CP35995 705 aa5.59□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W SIZ1Q04195 904 aa5.59□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W DCS2Q12123 353 aa5.59□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W PHM7Q12252 991 aa5.59□□□□□ -1.51
YKR047WYKR047W CHS2P14180 963 aa5.58□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W YCK2P23292 546 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W FAT1P38225 669 aa5.58□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W HIS6P40545 261 aa5.58□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W RNR4P49723 345 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W PSP2P50109 593 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W FOL2P51601 243 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W PCL10P53124 433 aa5.58□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W YMR187CQ03236 431 aa5.58□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W NKP1Q12493 238 aa5.58□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W ADP1P25371 1049 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W YKR075CP36155 307 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W RRP8P38961 392 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W PAP2P53632 584 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data5.57□□□□□ -1.52not detected
YKR047WYKR047W CMP2P14747 604 aa5.56□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W KTR4P38131 464 aa5.56□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W YHL041WP38730 149 aa5.56□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W SSY5P47002 699 aa5.56□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W YJR039WP47107 1121 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.9 ms