RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	YBR053C	P38235	358 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	PFA3	P42836	336 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
YKL063C	YKL063C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	PER1	P25625	357 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	PZF1	P39933	429 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	NIT3	P49954	291 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	PKH1	Q03407	766 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	CRR1	Q05790	422 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	ADY4	Q05955	493 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	IRC10	Q08118	586 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	IRC13	Q08630	104 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL063C	YKL063C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
YKL063C	YKL063C	EMC3	P36039	253 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	PEX2	P32800	271 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	SDS3	P40505	327 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	HUL4	P40985	892 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	YJL163C	P46996	555 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	TGL5	Q12043	749 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	SUT2	Q12286	268 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	GPR1	Q12361	961 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	CAN1	P04817	590 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	PCL5	P38794	229 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	ALG2	P43636	503 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	TIM44	Q01852	431 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	NRG1	Q03125	231 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	RSC3	Q06639	885 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	MET7	Q08645	548 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	YLR415C	O13578	112 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	STU2	P46675	888 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	THI21	Q08975	551 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	SHR5	P41912	237 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	HXT16	P47185	567 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	BDF2	Q07442	638 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	YHL017W	P38745	532 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	SPC29	P33419	253 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	TDP1	P38319	544 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	ATF1	P40353	525 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	HOS4	P40480	1083 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	DAM1	P53267	343 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKL063C	YKL063C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
YKL063C	YKL063C	BCD1	P38772	366 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	BNR1	P40450	1375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	YIR042C	P40586	236 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	ZIP2	P53061	704 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	DIF1	O13577	133 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	DAS1	P47005	663 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	ALY2	P47029	1046 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	AMA1	P50082	593 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	NGG1	P32494	702 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	SIC1	P38634	284 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	ATP25	Q03153	612 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	REH1	Q06709	432 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	PPZ2	P33329	710 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	MTL1	P53214	551 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	NSE3	Q05541	303 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	GAL11	P19659	1081 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	HIR1	P32479	840 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	UBC11	P52492	156 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	MAL11	P53048	616 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	KIN3	P22209	435 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	FLO10	P36170	1169 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	GDH3	P39708	457 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	FMP52	P40008	231 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	TAH11	P47112	604 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL063C	YKL063C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	TIM23	P32897	222 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	YHR112C	P38716	378 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	SFB3	P38810	929 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	LYS9	P38999	446 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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