RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHC3	YJL059W	YPL191C	Q08930	360 aa		7.52	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	SMC6	Q12749	1114 aa		7.52	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	CDC9	P04819	755 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.51	□□□□□ -1.21	not detected
YHC3	YJL059W	SAN1	P22470	610 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	DUR3	P33413	735 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	YKL107W	P34251	309 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	JEM1	P40358	645 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	QRI7	P43122	407 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	YGL140C	P53120	1219 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	YNL058C	P53947	316 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	YDR286C	Q05530	114 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	RSC58	Q07979	502 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	SRB8	P25648	1427 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	YER152C	P10356	443 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	RGP1	P16664	663 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	SPO16	P17122	198 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	PCL2	P25693	308 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	RAD16	P31244	790 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	SEG2	P34250	1132 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	YBR284W	P38150	797 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	YHR218W	P38899	603 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	DOT5	P40553	215 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	ALG2	P43636	503 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	CTH1	P47976	325 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	MRPL19	P53875	158 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	PEX13	P80667	386 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	GRX3	Q03835	250 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	COG8	Q04632	607 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	MDM38	Q08179	573 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	TAH18	Q12181	623 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	CEX1	Q12453	761 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.49	□□□□□ -1.21	not detected
YHC3	YJL059W	DID4	P36108	232 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	MCM7	P38132	845 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	HXT13	P39924	564 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	YIL166C	P40445	542 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	HXT17	P53631	564 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	HXT15	P54854	567 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	TDA9	Q04545	1251 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	PGC1	Q08959	321 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	STF1	P01098	86 aa		7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	MSH1	P25846	959 aa		7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	IRE1	P32361	1115 aa		7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	PAN5	P38787	379 aa		7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	YIL165C	P40446	119 aa		7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	YGL176C	P46945	554 aa		7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	DPH6	Q12429	685 aa		7.48	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	DBF4	P32325	704 aa		7.47	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	DAL3	P32459	195 aa		7.47	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	SHU2	P38957	223 aa		7.47	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	ZIP2	P53061	704 aa		7.47	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	PEX15	Q08215	383 aa		7.47	□□□□□ -1.21
YHC3	YJL059W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	PET10	P36139	283 aa		7.46	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	RIM11	P38615	370 aa		7.46	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	VPS53	P47061	822 aa		7.46	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	SKP1	P52286	194 aa		7.46	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	YKU80	Q04437	629 aa		7.46	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	HIM1	Q06674	414 aa		7.46	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	ENA1	P13587	1091 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	AAC3	P18238	307 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	UGA3	P26370	528 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	PAH1	P32567	862 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	MDJ1	P35191	511 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	PPE1	P38796	400 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	SIT1	P39980	628 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	YGR153W	P48238	217 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
YHC3	YJL059W	ENA2	Q01896	1091 aa		7.45	□□□□□ -1.22

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