RNA–Protein interactions for RNA: YJL028W

YJL028W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YJL028W, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL028W	YJL028W	KTR4	P38131	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	YHL041W	P38730	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	EMP65	P40085	556 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	HIS6	P40545	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	THI21	Q08975	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	FAT1	P38225	669 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	PEX7	P39108	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	YFL052W	P43551	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	CIT3	P43635	486 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	BNA2	P47125	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	PEX15	Q08215	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	APM4	Q99186	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	AI1	P03875	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	YKU70	P32807	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	AIM26	P32858	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	SRP101	P32916	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	PTH2	P34222	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	YKR018C	P36114	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	RFC5	P38251	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	AKR1	P39010	764 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	YGR035C	P53222	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	RCM1	P53972	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	VPS30	Q02948	557 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	DCS2	Q12123	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	APL1	P27351	700 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	SEC65	P29478	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	EXO84	P38261	753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	VID27	P40157	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	PRY1	P47032	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	ZIP2	P53061	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	PUS2	P53167	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
YJL028W	YJL028W	TRE1	Q08919	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL028W	YJL028W	MSS18	P08593	268 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	ATP12	P22135	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	DBF20	P32328	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	FLR1	P38124	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	ERP2	P39704	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	PCL10	P53124	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	ARP4	P80428	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	MSC2	Q03455	724 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	CDA1	Q06702	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	SPS1	P08458	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	HSF1	P10961	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	MAL31	P38156	614 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	POA1	P38218	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	PTC7	P38797	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	ACA1	P39970	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	GTS1	P40956	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	QRI7	P43122	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	TDA6	Q06466	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	PSR2	Q07949	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	PHM7	Q12252	991 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YJL028W	YJL028W	FBP1	P09201	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	SWI6	P09959	803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	YFL066C	P43538	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	YGR012W	P53206	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	COG4	Q06096	861 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	NSI1	Q12457	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	SAP185	P40856	1058 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	BFA1	P47113	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	RSM24	Q03976	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	THI72	Q08579	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL028W	YJL028W	SSH4	P32343	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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