RNA–Protein interactions for RNA: YHR107C

CDC12, Transcript of Component of the septin ring that is required for cytokinesis, yeast

Gene CDC12, Length 1,224 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CDC12	YHR107C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	DNM1	P54861	757 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	RPN4	Q03465	531 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	YDR306C	Q06640	478 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	RSC58	Q07979	502 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	FMP25	Q08023	583 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	FLC1	Q08967	793 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	ADE8	P04161	214 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SAM35	P14693	329 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	MGM1	P32266	881 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	AIM26	P32858	118 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	PTC7	P38797	343 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SPL2	P38839	148 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	TAT2	P38967	592 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	MXR1	P40029	184 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	GTS1	P40956	396 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	ALR2	P43553	858 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	MTC3	P53077	123 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	THI3	Q07471	609 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	YOL057W	Q08225	711 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	HKR1	P41809	1802 aa		5	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SPS1	P08458	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SNF5	P18480	905 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	PRD1	P25375	712 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	STE5	P32917	917 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	PEX7	P39108	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	CIT1	P00890	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	PSF2	P40359	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
CDC12	YHR107C	PFD1	P46988	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	GYP7	P48365	746 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	IRC4	Q03036	179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SSY1	Q03770	852 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	FLO11	P08640	1367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SLA2	P33338	968 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	NUP133	P36161	1157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	CCC2	P38995	1004 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	PSF3	Q12146	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SVS1	Q12254	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	SWI1	P09547	1314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDC12	YHR107C	TRP3	P00937	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
CDC12	YHR107C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	PPG1	P32838	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	LIP5	P32875	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	RFC5	P38251	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	GSC2	P40989	1895 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
CDC12	YHR107C	YKR073C	P36153	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
CDC12	YHR107C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	SIT1	P39980	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	RSM24	Q03976	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	IOC4	Q04213	475 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	UBX5	Q06682	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	SAC3	P46674	1301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	BI4	P03879	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	MRP7	P12687	371 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	ACE2	P21192	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	OMA1	P36163	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	YRO2	P38079	344 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	ERG7	P38604	731 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	YJR008W	P47085	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	OSW2	Q12202	724 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	RPC82	P32349	654 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	DOM34	P33309	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	NET1	P47035	1189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	VPS62	P53285	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	ORC3	P54790	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	SDH1	Q00711	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	LCD1	Q04377	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	THI22	Q06490	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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