RNA–Protein interactions for RNA: YHL011C

PRS3, Transcript of 5-phospho-ribosyl-1(alpha)-pyrophosphate synthetase, yeast

Gene PRS3, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRS3	YHL011C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
PRS3	YHL011C	MET3	P08536	511 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRS3	YHL011C	PPS1	P38148	807 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRS3	YHL011C	MUP1	P50276	574 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRS3	YHL011C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRS3	YHL011C	MCH5	Q08777	521 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRS3	YHL011C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRS3	YHL011C	SAP190	P36123	1033 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRS3	YHL011C	ALG2	P43636	503 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRS3	YHL011C	PKH1	Q03407	766 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRS3	YHL011C	BDF2	Q07442	638 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRS3	YHL011C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	OMS1	Q06668	471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	ADY4	Q05955	493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	RSC3	Q06639	885 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	MET7	Q08645	548 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	YLR415C	O13578	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	PER1	P25625	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	NGG1	P32494	702 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	PFA3	P42836	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	ASM4	Q05166	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	NSE3	Q05541	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	REH1	Q06709	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	THI21	Q08975	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	GAL11	P19659	1081 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	SPC29	P33419	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	MTH1	P35198	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	YBR053C	P38235	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	NNF1	P47149	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	GND2	P53319	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	TIM44	Q01852	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	NRG1	Q03125	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	ATP25	Q03153	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
PRS3	YHL011C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	SHR5	P41912	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	STU2	P46675	888 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	HXT16	P47185	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	AMA1	P50082	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	CRR1	Q05790	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	IRC10	Q08118	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	DIF1	O13577	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	SPC42	P36094	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	YJL163C	P46996	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	ZIP2	P53061	704 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	IRC13	Q08630	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	TGL5	Q12043	749 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	GPR1	Q12361	961 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	YPT53	P36019	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	YHL017W	P38745	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	YIR042C	P40586	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRS3	YHL011C	GDH3	P39708	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	DAS1	P47005	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	ALY2	P47029	1046 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	SDS3	P40505	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	PCL5	P38794	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	YML122C	Q03207	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	YBR259W	P38338	688 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	HOS4	P40480	1083 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	MAL11	P53048	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	MTC2	P34246	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	SIC1	P38634	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	BCD1	P38772	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	RIA1	P53893	1110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRS3	YHL011C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
PRS3	YHL011C	TIM23	P32897	222 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	MCD4	P36051	919 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	UBC11	P52492	156 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	YBP2	P53169	641 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	RPN4	Q03465	531 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	GAD1	Q04792	585 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	SUT2	Q12286	268 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
PRS3	YHL011C	FMP52	P40008	231 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	BAP3	P41815	604 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	SGO1	Q08490	590 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRS3	YHL011C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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