RNA–Protein interactions for RNA: YDR195W

REF2, Transcript of RNA-binding protein, yeast

Gene REF2, Length 1,602 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REF2	YDR195W	PZF1	P39933	429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	ELO3	P40319	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	PKH1	Q03407	766 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	YCL002C	P25565	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	SPC29	P33419	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	SSY5	P47002	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	MET7	Q08645	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	FRE5	Q08908	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	ACF2	Q12168	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	SAP190	P36123	1033 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	FKH2	P41813	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	UBA2	P52488	636 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	MRPS35	P53292	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	MCH5	Q08777	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
REF2	YDR195W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	SAK1	P38990	1142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	TIM44	Q01852	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	RSC3	Q06639	885 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	YLR415C	O13578	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	PFA3	P42836	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	HXT16	P47185	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	AMA1	P50082	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	ADY4	Q05955	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	STB4	P50104	949 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	MUP1	P50276	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	YBR053C	P38235	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	SIC1	P38634	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	GDH3	P39708	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	DAS1	P47005	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	ZIP2	P53061	704 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	NRG1	Q03125	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	RPN4	Q03465	531 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	TMN2	Q04562	672 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	GPR1	Q12361	961 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REF2	YDR195W	DIF1	O13577	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	OCA5	P38738	679 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	YIR042C	P40586	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	SHR5	P41912	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	MUK1	Q02866	612 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	PPS1	P38148	807 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	YHL017W	P38745	532 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	STU2	P46675	888 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	YJL163C	P46996	555 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	ALY2	P47029	1046 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	MAL11	P53048	616 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	PER1	P25625	357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	MTC2	P34246	357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	YBR259W	P38338	688 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	IRC10	Q08118	586 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	TGL5	Q12043	749 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	ECM1	P39715	212 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	BUD6	P41697	788 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	MTH1	P35198	433 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
REF2	YDR195W	SDS3	P40505	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	ASM4	Q05166	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	CRR1	Q05790	422 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	TIM23	P32897	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	RIA1	P53893	1110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	MDM12	Q92328	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REF2	YDR195W	MCD4	P36051	919 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	IRC13	Q08630	104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	HOS4	P40480	1083 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	BAP3	P41815	604 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	BNA2	P47125	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	GND2	P53319	492 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	SPC42	P36094	363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	FMP52	P40008	231 aa		4.75	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	NUP82	P40368	713 aa		4.75	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	CAF16	P43569	289 aa		4.75	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	YBP2	P53169	641 aa		4.75	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	GAD1	Q04792	585 aa		4.75	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	SGO1	Q08490	590 aa		4.75	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	GSY1	P23337	708 aa		4.75	□□□□□ -1.65
REF2	YDR195W	YPT53	P36019	220 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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