RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W QDR2P40474 542 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W AGE2P40529 298 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ALA1P40825 983 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ZIP2P53061 704 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W KAR5Q04746 504 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YLR287CQ05881 355 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W STE23Q06010 1027 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MPH2P0CD99 609 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TIF1P10081 395 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MRPL8P22353 238 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PEX1P24004 1043 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RDS1P25611 832 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W HSP30P25619 332 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PGM2P37012 569 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MRX3P38172 270 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ALD5P40047 520 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W GVP36P40531 326 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W GNP1P48813 663 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SQS1P53866 767 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RSM24Q03976 319 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W EAF1Q06337 982 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RSA1Q08932 381 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY2B-BQ12491 1770 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ARG81P05085 880 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W HSP60P19882 572 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W IME1P21190 360 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W DAL7P21826 554 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W DBF2P22204 572 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W URA1P28272 314 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VMA8P32610 256 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MRPL17P36528 281 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W HXT6P39003 570 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W HXT7P39004 570 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W DSS1P39112 969 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W INA22P40576 216 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VMA10P48836 114 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ARI1P53111 347 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ABZ2Q03266 374 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W COX20Q04935 205 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ALR1Q08269 859 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W STB3Q12427 513 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SES1P07284 462 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W NCP1P16603 691 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W NTG1P31378 399 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YKL050CP35736 922 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ALG3P38179 458 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ALG14P38242 237 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VMA22P38784 181 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PIK1P39104 1066 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RCY1P39531 840 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W JLP2P40206 208 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W BRE2P43132 505 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W AGX1P43567 385 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YGR021WP53212 290 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PEF1P53238 335 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SLT2Q00772 484 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SWP1Q02795 286 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YPL109CQ02981 657 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VHS3Q08438 674 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YOR378WQ08902 515 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MSH5Q12175 901 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YGR161W-CQ3E744 92 aa5.41□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W JIP3O13555 125 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YKL100CP34248 587 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RRN3P36070 627 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RRM3P38766 723 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VAC8P39968 578 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YEN1P40028 759 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YJR061WP40355 935 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YGL176CP46945 554 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W POL32P47110 350 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RSM7P47150 247 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SAP4P53036 818 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W GIM3P53900 129 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RRN5Q02983 363 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SHE9Q04172 456 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YDR286CQ05530 114 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YCS4Q06156 1176 aa5.4□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W HOP09932 586 aa5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MNN1P39106 762 aa5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W IES5P40060 125 aa5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SAP185P40856 1058 aa5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MMM1P41800 426 aa5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YNL193WP53870 558 aa5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RPM2Q02773 1202 aa5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RRI2Q12348 645 aa5.4□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TY1B-DR3Q99231 1755 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YMR084WA2P2R3 262 aa5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.8 ms