RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	DUS4	Q06063	367 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.41	□□□□□ -1.54	not detected
CPR4	YCR069W	PSF3	Q12146	194 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	YPL066W	Q12194	479 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	RKM4	Q12504	494 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	ACE2	P21192	770 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	MLC1	P53141	149 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	BDF2	Q07442	638 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	YIR014W	P40570	242 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	YGL176C	P46945	554 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	SIZ1	Q04195	904 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	IRC3	Q06683	689 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	ADR1	P07248	1323 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	YKL107W	P34251	309 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	SPO20	Q04359	397 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	GPB1	Q08886	897 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	CTS1	P29029	562 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	DOM34	P33309	386 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	TAT2	P38967	592 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	HFM1	P51979	1187 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	YGR053C	P53234	283 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	ERO1	Q03103	563 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	MSC2	Q03455	724 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	NKP2	Q06162	153 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	RXT3	Q07458	294 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	PDR18	P53756	1333 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	CTT1	P06115	562 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	CDC6	P09119	513 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	CDC20	P26309	610 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	SWC3	P31376	625 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	ERT1	P38140	529 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.36	□□□□□ -1.55	not detected
CPR4	YCR069W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	YGL242C	P53066	181 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	GDE1	Q02979	1223 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	ESC2	Q06340	456 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	GRX6	Q12438	231 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	POM152	P39685	1337 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	CYB2	P00175	591 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	GCV2	P49095	1034 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	MTC3	P53077	123 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	UBP16	Q02863	499 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	SVF1	Q05515	481 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CPR4	YCR069W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	CLN2	P20438	545 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	OPI1	P21957	404 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	MAD1	P40957	749 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	VPS62	P53285	467 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	FCP1	Q03254	732 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	YAP6	Q03935	383 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	XYL2	Q07993	356 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	FIG2	P25653	1609 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.32	□□□□□ -1.56	not detected
CPR4	YCR069W	YKL151C	P36059	337 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	SPO22	P40511	975 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	MND2	P40577	368 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	CWC24	P53769	259 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	VPS16	Q03308	798 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	TMA10	Q06177	86 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	CTI6	Q08923	506 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	HMI1	Q12039	706 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	RRI2	Q12348	645 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	KRE2	P27809	442 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	LST4	P34239	828 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	IOC3	P43596	787 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	THI3	Q07471	609 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	PIN2	Q12057	282 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	OSW2	Q12202	724 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	EMC1	P25574	760 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	MGM1	P32266	881 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	YAP1801	P38856	637 aa		5.3	□□□□□ -1.56

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