RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 KIF15Q9NS87 1388 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 C3P01024 1663 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 KIF3BO15066 747 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 SCNN1AP37088 669 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 NPATQ14207 1427 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 NGLY1Q96IV0 654 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 TXLNAP40222 546 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 HSPA2P54652 639 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 GGT6Q6P531 493 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 SEPT3Q9UH03 358 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 MROH2AA6NES4 1674 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 ABCC3O15438 1527 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 ERBINQ96RT1 1412 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 PTSQ03393 145 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 RTN1Q16799 776 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 C16orf46Q6P387 395 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 MYO19Q96H55 970 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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PRPF8-211ENST00000574728 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 ABL1P00519 1130 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 F11P03951 625 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 MSX1P28360 303 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 SERPINB4P48594 390 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 HIF1AQ16665 826 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 ROCK1Q13464 1354 aa7.28□□□□□ -1.24
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PRPF8-211ENST00000574728 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 SLC35F4A4IF30 521 aa7.27□□□□□ -1.25
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PRPF8-211ENST00000574728 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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PRPF8-211ENST00000574728 HELQQ8TDG4 1101 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 GPAMQ9HCL2 828 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 COX20Q5RI15 118 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 DGKZQ13574 1117 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.25□□□□□ -1.25
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PRPF8-211ENST00000574728 ZIC5Q96T25 663 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 STRCQ7RTU9 1775 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 A0A1W2PNR3 127 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 POTECB2RU33 542 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 H7C1W4 665 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 EFHC2Q5JST6 749 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 RUBCNLQ9H714 662 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.24□□□□□ -1.25
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