RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.85■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPS6KB1P23443 525 aa23.85■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.85■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP5JP18859 108 aa23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 NBPF26B4DH59 902 aa23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 CASP7P55210 303 aa23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 NBPF14Q5TI25 921 aa23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF20Q5VTR2 975 aa23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 NBPF15Q8N660 670 aa23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.84■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.83■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.83■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.83■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.83■■□□□ 1.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.82■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF609O15014 1411 aa23.82■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 OFD1O75665 1012 aa23.82■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.81■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.81■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP25Q9UHP3 1055 aa23.81■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 JCADQ9P266 1359 aa23.81■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.8■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 GLI3P10071 1580 aa23.8■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXO4P98177 505 aa23.79■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC6Q86TZ1 520 aa23.79■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.79■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 A1BGP04217 495 aa23.79■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.78■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.78■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.78■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.78■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 HAUS7Q99871 368 aa23.78■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.78■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 JAK2O60674 1132 aa23.77■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP21A2P08686 494 aa23.77■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 TIMM10P62072 90 aa23.77■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD1Q15327 319 aa23.77■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.77■■□□□ 1.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.76■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.76■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.76■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.75■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.75■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 NEK1Q96PY6 1258 aa23.75■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 H7C1W4 665 aa23.75■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 GOLIM4O00461 696 aa23.74■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.74■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.74■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 Q6ZUG5 572 aa23.74■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT85P78386 507 aa23.74■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC24Q50LG9 513 aa23.74■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.74■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADCY5O95622 1261 aa23.73■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCC6O95255 1503 aa23.73■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A0G2JLW4 131 aa23.73■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 LIG1P18858 919 aa23.73■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.73■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDCP20941 246 aa23.72■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLCB2Q00722 1185 aa23.72■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 UVSSAQ2YD98 709 aa23.72■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.72■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAMK4Q16566 473 aa23.72■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.72■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.72■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 CPDO75976 1380 aa23.71■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 GTF3C6Q969F1 213 aa23.71■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX11Q96FC9 970 aa23.71■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCCP43146 1447 aa23.71■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT32Q14532 448 aa23.71■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
AFG3L1P-217ENST00000557444 AP5Z1O43299 807 aa23.7■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSPA2P54652 639 aa23.7■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 BRF1Q92994 677 aa23.7■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.7■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 MCM5P33992 734 aa23.7■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.69■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.69■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.68■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPFIA3O75145 1194 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 170.2 ms