RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF7Q2M1P5 1343 aa13.77□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPNDQ8N594 471 aa13.77□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.76□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUSD4Q5VX71 490 aa13.76□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOB2Q70IA6 237 aa13.76□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SULF1Q8IWU6 871 aa13.76□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDCA5Q96FF9 252 aa13.76□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL6A3P12111 3177 aa13.75□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSMD14O00487 310 aa13.75□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.75□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.75□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CUL9Q8IWT3 2517 aa13.74□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.74□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKTNO75072 461 aa13.74□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAS2L2Q8NHY3 880 aa13.74□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGA3Q9NZ52 723 aa13.74□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIC1Q4ADV7 1423 aa13.73□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCC4O15439 1325 aa13.73□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.73□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPF2Q92785 391 aa13.73□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NLRP3Q96P20 1036 aa13.73□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB3Q9H5J0 574 aa13.73□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DBNDD1Q9H9R9 158 aa13.73□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.73□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM17Q9Y577 477 aa13.73□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIMBP2O15034 1052 aa13.72□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGL2O15211 777 aa13.72□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.72□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.72□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEP290O15078 2479 aa13.72□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF6Q6ZMV9 814 aa13.71□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SP8Q8IXZ3 490 aa13.71□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.71□□□□□ -0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H0YGN5 161 aa13.7□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NTSR2O95665 410 aa13.7□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.7□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa13.69□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.69□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYL6BP14649 208 aa13.69□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TM4SF4P48230 202 aa13.69□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOK7Q18PE1 504 aa13.69□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WASHC4Q2M389 1173 aa13.69□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.69□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MCM10Q7L590 875 aa13.69□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa13.69□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BBOX1O75936 387 aa13.68□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCARF1Q14162 830 aa13.68□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OTOP1Q7RTM1 612 aa13.68□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHACTR3Q96KR7 559 aa13.68□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIS18AQ9NYP9 233 aa13.68□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYCP01106 439 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCTN1Q14203 1278 aa13.67□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa13.67□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF428Q96B54 188 aa13.67□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OTUD5Q96G74 571 aa13.67□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.67□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C6orf229H3BNL8 230 aa13.66□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ECE2O60344 883 aa13.66□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS12P25398 132 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKBP1BP68106 108 aa13.66□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SREBF2Q12772 1141 aa13.66□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.66□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKG1Q13976 671 aa13.65□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.65□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTL9Q8NET4 1388 aa13.65□□□□□ -0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP98P52948 1817 aa13.64□□□□□ -0.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.64□□□□□ -0.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKAR2BP31323 418 aa13.63□□□□□ -0.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRAPQ13588 217 aa13.63□□□□□ -0.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC10A5Q5PT55 438 aa13.63□□□□□ -0.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.63□□□□□ -0.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCIRG1Q13488 830 aa13.62□□□□□ -0.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa13.62□□□□□ -0.23
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