RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484046.1

TM4SF1-AS1-201, TM4SF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TM4SF1-AS1, Length 488 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SMAPO00193 183 aa7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C21orf2O43822 256 aa7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NBPF4Q96M43 638 aa7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZIC5Q96T25 663 aa7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PNMA3Q9UL41 463 aa7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.94□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.93□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NBPF26B4DH59 902 aa7.93□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRAF5O00463 557 aa7.93□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HOXC9P31274 260 aa7.93□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NOGQ13253 232 aa7.93□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.93□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.93□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATG3Q9NT62 314 aa7.93□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.93□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 H0YIN7 160 aa7.92□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.92□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NLRP7Q8WX94 980 aa7.92□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.92□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RCCD1A6NED2 376 aa7.91□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.91□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.91□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MPNDQ8N594 471 aa7.91□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EVC2Q86UK5 1308 aa7.91□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RTL1A6NKG5 1358 aa7.9□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NFIXQ14938 502 aa7.9□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SZT2Q5T011 3432 aa7.9□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 A0A0C4DFX4 3053 aa7.9□□□□□ -1.14
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CELF2O95319 508 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.89□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GPC2Q8N158 579 aa7.89□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RNF186Q9NXI6 227 aa7.89□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.89□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.89□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FZD9O00144 591 aa7.88□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRPA1O75762 1119 aa7.88□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SERPINB2P05120 415 aa7.88□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DNAJB2P25686 324 aa7.88□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NEUROD2Q15784 382 aa7.88□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SOGA3Q5TF21 947 aa7.88□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.88□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 AMPHP49418 695 aa7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NBPF3Q9H094 633 aa7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.87□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.86□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NCAPD2Q15021 1401 aa7.86□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BCORQ6W2J9 1755 aa7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZPR1O75312 459 aa7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MS4A1P11836 297 aa7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CLCN1P35523 988 aa7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EPS15P42566 896 aa7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SCNN1DP51172 638 aa7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FBLN1P23142 703 aa7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PDE6BP35913 854 aa7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SYNE4Q8N205 404 aa7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CNKSR1Q969H4 720 aa7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 COL6A3P12111 3177 aa7.83□□□□□ -1.16
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 H0YGN5 161 aa7.83□□□□□ -1.16
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PHKG2P15735 406 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms