RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 CNTROBQ8N137 903 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 NUCB2P80303 420 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 AK9Q5TCS8 1911 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 EP400Q96L91 3159 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.45■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 RABEP1Q15276 862 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 DYNC1I1O14576 645 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 A0A0G2JS52 829 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 TFCP2Q12800 502 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 HLFQ16534 295 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 IL25Q9H293 177 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 SSFA2P28290 1259 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 TNNI3KQ59H18 835 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-204ENST00000352260 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 SGSM2O43147 1006 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 EVI5LQ96CN4 794 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 MCCP23508 829 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 SOCS7O14512 581 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 ATP6V1AP38606 617 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 SIK1P57059 783 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 NLRP10Q86W26 655 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 PALLDQ8WX93 1383 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 GPTP24298 496 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 FAM89AQ96GI7 184 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 KCNQ2O43526 872 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 UQCRHP07919 91 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 ITPK1Q13572 414 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 RREB1Q92766 1687 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 EYA2O00167 538 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 PALD1Q9ULE6 856 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-204ENST00000352260 ANAPC15P60006 121 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 CIAO1O76071 339 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 ATP5JP18859 108 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC24Q50LG9 513 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 IL17RAQ96F46 866 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 NUP98P52948 1817 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 ST18O60284 1047 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 CSF1RP07333 972 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 GPR108Q9NPR9 543 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 RAD50Q92878 1312 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 FAM182BQ5T319 152 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 SYNE4Q8N205 404 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 HSPA4P34932 840 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.3■■□□□ 1.16
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