RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 RAD50Q92878 1312 aa23.53■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 HLA-DOAP06340 250 aa23.53■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 DESP17661 470 aa23.53■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.53■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 KIF18AQ8NI77 898 aa23.53■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 WTAPQ15007 396 aa23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 KCNA6P17658 529 aa23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 POTEJP0CG39 1038 aa23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 ESR2Q92731 530 aa23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC102BQ68D86 513 aa23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 VPS36Q86VN1 386 aa23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 CALML4Q96GE6 196 aa23.52■■□□□ 1.36
LRIG1-201ENST00000273261 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 USP25Q9UHP3 1055 aa23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 ZBTB43O43298 467 aa23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 KIF5CO60282 957 aa23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 ATP6V1AP38606 617 aa23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 TOM1O60784 492 aa23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.51■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.5■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 H0YHG0 523 aa23.5■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 CEP170Q5SW79 1584 aa23.5■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 NLRP3Q96P20 1036 aa23.5■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.5■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 DDB1Q16531 1140 aa23.5■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 SETDB2Q96T68 719 aa23.5■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.5■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 IL13P35225 146 aa23.49■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.49■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.49■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF165P49910 485 aa23.49■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.49■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.49■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 GNAT2P19087 354 aa23.48■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 NYXQ9GZU5 481 aa23.48■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 CYP7A1P22680 504 aa23.48■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 GNAQP50148 359 aa23.48■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 CABP5Q9NP86 173 aa23.48■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 YEATS4O95619 227 aa23.48■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.48■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 UBA7P41226 1012 aa23.47■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.47■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 PLXNC1O60486 1568 aa23.47■■□□□ 1.35
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LRIG1-201ENST00000273261 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.47■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.47■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 TRAF1Q13077 416 aa23.47■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 CETN2P41208 172 aa23.46■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.46■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 TNNQ9UQP3 1299 aa23.46■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.46■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.46■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.46■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LRIG1-201ENST00000273261 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 NECAB1Q8N987 351 aa23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 RTN1Q16799 776 aa23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 ALG1Q9BT22 464 aa23.45■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 MCM3P25205 808 aa23.44■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 ADCY5O95622 1261 aa23.44■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 Q6ZUG5 572 aa23.44■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 RMND1Q9NWS8 449 aa23.44■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.44■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 SIRT1Q96EB6 747 aa23.44■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 CASQ1P31415 396 aa23.43■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.43■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 KRT24Q2M2I5 525 aa23.43■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 PTPRTO14522 1441 aa23.43■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 F13A1P00488 732 aa23.43■■□□□ 1.34
LRIG1-201ENST00000273261 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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