RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa24.78■■□□□ 1.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stk32bQ9JJX8 414 aa24.77■■□□□ 1.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Best3Q6H1V1 669 aa24.77■■□□□ 1.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gdf11Q9Z1W4 405 aa24.77■■□□□ 1.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Col24a1Q30D77 1733 aa24.76■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1700029H14RikE9PY36 240 aa24.76■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ube4aE9Q735 1028 aa24.76■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Celf1P28659 486 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mum1Q6DID5 682 aa24.76■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 L3mbtl2P59178 703 aa24.75■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam122aQ9DB52 284 aa24.75■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Setdb1O88974 1307 aa24.75■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc38a10Q5I012 1090 aa24.74■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scn9aQ62205 1984 aa24.74■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adora1Q60612 326 aa24.73■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Jarid2Q62315 1234 aa24.73■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Skor1Q8BX46 964 aa24.73■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NpcdF8VQB8 469 aa24.72■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 EvplQ9D952 2035 aa24.72■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vsig10D3YX43 558 aa24.71■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp48Q3V0C5 1052 aa24.71■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slfn1Q9Z0I7 337 aa24.71■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prl3d2F6R3P9 224 aa24.7■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bend4P86174 541 aa24.7■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa24.7■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rwdd1Q9CQK7 243 aa24.7■■□□□ 1.55
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 IntuQ059U7 942 aa24.7■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf496Q5SXI5 585 aa24.7■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tgfb1i1Q62219 461 aa24.7■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plekhg6Q8R0J1 787 aa24.7■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa24.7■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pank1Q8K4K6 548 aa24.69■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Il15P48346 162 aa24.68■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrch1P62046 709 aa24.68■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Col3a1P08121 1464 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ankrd44B2RXR6 993 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MvpQ9EQK5 861 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ly6iQ9WU67 134 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eddm13E9Q7F5 164 aa24.66■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gpr182P43142 395 aa24.66■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rapgefl1Q68EF8 662 aa24.66■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stk36Q69ZM6 1316 aa24.65■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bin2D3Z6Q9 489 aa24.65■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tceal9Q9DD24 104 aa24.65■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trim58Q5NCC9 485 aa24.64■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa24.64■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc14a2Q8R4T9 930 aa24.64■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem143Q8VD26 458 aa24.64■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Chmp3Q9CQ10 224 aa24.64■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Phrf1A6H619 1682 aa24.64■■□□□ 1.54
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prkar2bP31324 416 aa24.64■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fgd1P52734 960 aa24.64■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sh3bp5Q9Z131 463 aa24.64■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Glt1d1A4FUP9 346 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ell2Q3UKU1 639 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Glis2Q8VDL9 521 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plekho1Q9JIY0 408 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Psmd1Q3TXS7 953 aa24.62■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Glis3Q6XP49 780 aa24.62■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dcdc2bF7BCK0 340 aa24.61■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ftl2P49945 183 aa24.6■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Map9Q3TRR0 646 aa24.6■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Aldh1l2Q8K009 923 aa24.6■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa24.59■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eif6O55135 245 aa24.59■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plcd4Q8K3R3 807 aa24.59■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 LratQ9JI60 231 aa24.58■■□□□ 1.53
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cfap44E9Q5M6 1843 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mical3Q8CJ19 1993 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NynrinQ5DTZ0 1840 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AppP12023 770 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 VgfQ0VGU4 617 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc93Q7TQK5 629 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dhx38Q80X98 1228 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q8C5K5 320 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Osbpl5Q9ER64 874 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scn11aQ9R053 1765 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Col1a1P11087 1453 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ier5O89113 308 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GabrdP22933 449 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf710Q3U288 666 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sytl4Q9R0Q1 673 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sult6b1P0CC03 303 aa24.55■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Casp1P29452 402 aa24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.2 ms