RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039961.11

6820408C15Rik-201, Transcript of RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene 6820408C15Rik, Length 1,684 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Nkx1-2P42580 305 aa23.52■■□□□ 1.36
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Tmc1Q8R4P5 757 aa23.52■■□□□ 1.36
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Ube4aE9Q735 1028 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Wdhd1P59328 1117 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 DbnlQ62418 436 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Zkscan8Q8BSL0 588 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Rhot2Q8JZN7 620 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 EappQ5BU09 281 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 RestQ8VIG1 1082 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Kif2cQ922S8 721 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Gja10Q9WUS4 505 aa23.51■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Sned1Q70E20 1403 aa23.5■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Tmem266Q8BZB3 538 aa23.5■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Ambra1A2AH22 1300 aa23.5■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa23.5■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Nphp3Q7TNH6 1325 aa23.5■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Col3a1P08121 1464 aa23.5■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Bin2D3Z6Q9 489 aa23.49■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 CpzQ8R4V4 654 aa23.49■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 St5Q924W7 1134 aa23.49■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Q9D2X8 372 aa23.49■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Phrf1A6H619 1682 aa23.49■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Msl1Q6PDM1 616 aa23.48■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Aknad1E9Q8N6 675 aa23.48■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1810065E05RikQ5NC41 235 aa23.48■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Asap2Q7SIG6 958 aa23.47■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Strip1Q8C079 837 aa23.47■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Scn11aQ9R053 1765 aa23.47■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Gm7347D3YYI9 267 aa23.46■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1700029H14RikE9PY36 240 aa23.46■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Pde8bE9Q4S1 865 aa23.46■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Speer4aF8VPX6 267 aa23.46■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Timm10P62073 90 aa23.46■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Atp2b3Q0VF55 1220 aa23.46■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa23.46■■□□□ 1.35
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 GapdhsQ64467 440 aa23.45■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Brf1Q8CFK2 676 aa23.45■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Plekhf1Q3TB82 279 aa23.44■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 VeztQ3ZK22 780 aa23.44■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Tmem143Q8VD26 458 aa23.44■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Ppp6r3Q922D4 844 aa23.44■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Kcnq5Q9JK45 933 aa23.44■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Speer4dL7N216 212 aa23.43■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 TsksO54887 585 aa23.43■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Unc5clQ6R653 518 aa23.43■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa23.43■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 OscarQ8VBT3 265 aa23.43■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Heg1E9Q7X6 1337 aa23.42■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Ift57Q8BXG3 429 aa23.42■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Krt25Q8VCW2 446 aa23.42■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Col23a1Q8K4G2 532 aa23.41■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Adarb2Q9JI20 745 aa23.41■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Rps8P62242 208 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Kiaa0753Q6A000 959 aa23.41■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Slc39a11Q8BWY7 342 aa23.41■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Dydc2Q9D3X8 139 aa23.41■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Chrna2Q91X60 512 aa23.4■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Riok1Q922Q2 567 aa23.4■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Naa16Q9DBB4 864 aa23.4■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 StrcQ8VIM6 1809 aa23.4■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 GabrdP22933 449 aa23.39■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Stk3Q9JI10 497 aa23.39■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Sh3bp5Q9Z131 463 aa23.39■■□□□ 1.34
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Slc4a1P04919 929 aa23.38■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Sept1P42209 366 aa23.38■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Rdm1Q9CQK3 281 aa23.38■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa23.38■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Gm4340L7N2C4 268 aa23.38■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Zbtb45Q52KG4 520 aa23.38■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 ErfeQ6PGN1 340 aa23.38■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Fam160b2Q80YR2 744 aa23.38■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa23.38■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Oas2E9Q9A9 742 aa23.37■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Slurp2P0DP59 97 aa23.37■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Prune1Q8BIW1 454 aa23.37■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Kcnn1Q9EQR3 537 aa23.37■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Map3k15A2AQW0 1331 aa23.37■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Il15P48346 162 aa23.36■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Znf496Q5SXI5 585 aa23.36■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Lgr5Q9Z1P4 907 aa23.36■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Setdb1O88974 1307 aa23.36■■□□□ 1.33
6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.1 ms