RNA–Protein interactions for RNA: YOR087W

YVC1, Transcript of Vacuolar cation channel, yeast

Gene YVC1, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YVC1	YOR087W	DAL7	P21826	554 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	RSC6	P25632	483 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	MDL2	P33311	773 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	HSL7	P38274	827 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	RET2	P43621	546 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	HXT16	P47185	567 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	PIP2	P52960	996 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	YGR021W	P53212	290 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	SFB2	P53953	876 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	MET14	Q02196	202 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	EAR1	Q03212	550 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	RSB1	Q08417	382 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	OSW2	Q12202	724 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	ENA1	P13587	1091 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	SAM35	P14693	329 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	HSP78	P33416	811 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	TDA3	P38758	523 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	NIC96	P34077	839 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	EMP65	P40085	556 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	YVC1	Q12324	675 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	DIF1	O13577	133 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	PTP2	P29461	750 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	HFM1	P51979	1187 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	BUD9	P53226	547 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	PHM6	Q05637	104 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	SVS1	Q12254	260 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	NKP1	Q12493	238 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	AI3	P03877	415 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	GAL1	P04385	528 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	MIH1	P23748	554 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	YKL133C	P36066	463 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	RIM4	P38741	713 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	YAP1801	P38856	637 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	MMM1	P41800	426 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	SDH1	Q00711	640 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	ECM9	Q02202	377 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	RSC58	Q07979	502 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	GAS5	Q08193	484 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	TRK2	P28584	889 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	BIT2	P38346	545 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	SHR5	P41912	237 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	SPC105	P53148	917 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	YNR014W	P53719	212 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	VPS30	Q02948	557 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	SKY1	Q03656	742 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	HPF1	Q05164	967 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	MLC2	Q06580	163 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	PTH2	P34222	208 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	SAP190	P36123	1033 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	CIT3	P43635	486 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	YCL002C	P25565	263 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	DAL3	P32459	195 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	SLD3	P53135	668 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	NPY1	P53164	384 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	MDG1	P53885	366 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YVC1	YOR087W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	KCC4	P25389	1037 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	STE13	P33894	931 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	CEP3	P40969	608 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	HDA1	P53973	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	APM4	Q99186	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	AI1	P03875	834 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	RFC5	P38251	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	ERP2	P39704	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	YFL052W	P43551	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	BNA2	P47125	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YVC1	YOR087W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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