RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	TRE1	Q08919	783 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	PER1	P25625	357 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	RPC82	P32349	654 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	RTS3	P53289	263 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	DAL3	P32459	195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	SVS1	Q12254	260 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	GSY1	P23337	708 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	SEC6	P32844	805 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	GUP2	Q08929	609 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	APM4	Q99186	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	CCZ1	P38273	704 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	ENV11	P53246	860 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	RPD3	P32561	433 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	YKR051W	P36142	418 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	AKR1	P39010	764 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
DSS1	YMR287C	SND1	Q04007	877 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	COQ4	O13525	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	RCM1	P53972	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	DAL7	P21826	554 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	STE14	P32584	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	MNN4	P36044	1178 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
DSS1	YMR287C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	NHX1	Q04121	633 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	YKR018C	P36114	725 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	SSY1	Q03770	852 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	HFI1	Q12060	488 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	ATP4	P05626	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	YPT7	P32939	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	HFD1	Q04458	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	NUP145	P49687	1317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	CDC26	P14724	124 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	GID8	P40208	455 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	BNA2	P47125	453 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	PLB2	Q03674	706 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	SLX4	Q12098	748 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	FAT1	P38225	669 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	RFC5	P38251	354 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	NSG2	P53898	299 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	ADY3	Q07732	790 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	TRP3	P00937	484 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	HSP78	P33416	811 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	NIT1	P40447	199 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	RET2	P43621	546 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	REH1	Q06709	432 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	ATP12	P22135	325 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	PTC7	P38797	343 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	PEX14	P53112	341 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	GUD1	Q07729	489 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSS1	YMR287C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	CTF8	P38877	133 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	CTH1	P47976	325 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	TFC4	P33339	1025 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	OAF3	P36023	863 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	FUI1	P38196	639 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	PEA2	P40091	420 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	DUS4	Q06063	367 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	YKR073C	P36153	106 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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