RNA–Protein interactions for RNA: YMR019W

STB4, Transcript of Putative transcription factor, yeast

Gene STB4, Length 2,850 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB4	YMR019W	GUD1	Q07729	489 aa		2.59	□□□□□ -1.99
STB4	YMR019W	SRD1	P09007	221 aa		2.59	□□□□□ -1.99
STB4	YMR019W	CMP2	P14747	604 aa		2.59	□□□□□ -1.99
STB4	YMR019W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
STB4	YMR019W	GRX4	P32642	244 aa		2.59	□□□□□ -1.99
STB4	YMR019W	POA1	P38218	177 aa		2.59	□□□□□ -1.99
STB4	YMR019W	YFL054C	P43549	646 aa		2.59	□□□□□ -1.99
STB4	YMR019W	THI73	Q07904	523 aa		2.59	□□□□□ -1.99
STB4	YMR019W	CDC9	P04819	755 aa		2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	SRP101	P32916	621 aa		2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	STE13	P33894	931 aa		2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MTC2	P34246	357 aa		2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	HSL7	P38274	827 aa		2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YKE2	P52553	114 aa		2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MTC3	P53077	123 aa		2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	SFB2	P53953	876 aa		2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MSC2	Q03455	724 aa		2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	NHX1	Q04121	633 aa		2.59	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	HOG1	P32485	435 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	HSP78	P33416	811 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	GRX7	P38068	203 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	TAD1	P53065	400 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	ORC3	P54790	616 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YKR011C	Q02209	353 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
STB4	YMR019W	OMA1	P36163	345 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YJR008W	P47085	338 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MAL11	P53048	616 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	NPY1	P53164	384 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	SGD1	Q06132	899 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	TRE2	Q08693	809 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
STB4	YMR019W	GIN4	Q12263	1142 aa		2.58	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	SFL1	P20134	766 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MEF1	P25039	761 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	PER1	P25625	357 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	AFR1	P33304	620 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MAC1	P35192	417 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YKR075C	P36155	307 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	XYL2	Q07993	356 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	GUP2	Q08929	609 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	TOP1	P04786	769 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	SED4	P25365	1065 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	ECL1	P48235	211 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	CRR1	Q05790	422 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	RXT3	Q07458	294 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	BRE4	Q07660	1125 aa		2.57	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	SPE1	P08432	466 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	SWE1	P32944	819 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	CKB2	P38930	258 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MND2	P40577	368 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YBP2	P53169	641 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	GAL10	P04397	699 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	ERT1	P38140	529 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	TDA3	P38758	523 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	PZF1	P39933	429 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MGS1	P40151	587 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	ORC4	P54791	529 aa		2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	TRP3	P00937	484 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	PAF1	P38351	445 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	CDA1	Q06702	301 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YLR001C	Q07895	862 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.55	□□□□□ -2	not detected
STB4	YMR019W	PCL2	P25693	308 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MCD4	P36051	919 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	DID4	P36108	232 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YKR073C	P36153	106 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	APT2	P36973	181 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MAL31	P38156	614 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YGR153W	P48238	217 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	MET13	P53128	600 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YOR022C	Q12204	715 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	SWM1	Q12379	170 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	YHR078W	P38799	552 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	LAM1	P38851	1228 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	NPP2	P39997	493 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	RTS3	P53289	263 aa		2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
STB4	YMR019W	ATG33	Q06485	197 aa		2.55	□□□□□ -2

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