RNA–Protein interactions for RNA: YKL062W

MSN4, Transcript of Stress-responsive transcriptional activator, yeast

Gene MSN4, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSN4	YKL062W	GYP7	P48365	746 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	MEH1	Q02205	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	ATG16	Q03818	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	SCT1	P32784	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	BLI1	P35727	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	NPP2	P39997	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	SLX4	Q12098	748 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	OPI1	P21957	404 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	NPP1	P25353	742 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	DPB3	P27344	201 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YBR284W	P38150	797 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	IES5	P40060	125 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	VID27	P40157	782 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	HUL4	P40985	892 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	ENA1	P13587	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	AFR1	P33304	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YER158C	P40095	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	SFB2	P53953	876 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	LCD1	Q04377	747 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	SOD2	P00447	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	PIF1	P07271	859 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	IRC24	P40580	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	GCN5	Q03330	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	RPC82	P32349	654 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	RIM8	P53179	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
MSN4	YKL062W	TAF8	Q03750	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	DUS4	Q06063	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	THI4	P32318	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	UBP5	P39944	805 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	MND2	P40577	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	DAS1	P47005	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YJR120W	P47157	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YGR012W	P53206	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	ADR1	P07248	1323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	CAN1	P04817	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	ERT1	P38140	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	TOK1	P40310	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	SPT20	P50875	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	RXT3	Q07458	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	TMA17	Q12513	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	TOP3	P13099	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	SRP101	P32916	621 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	REC104	P33323	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	TOD6	P34219	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	THI80	P35202	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	PET10	P36139	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	GCV2	P49095	1034 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YKE2	P52553	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	SND1	Q04007	877 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	CDA1	Q06702	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	GPB1	Q08886	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	HSF1	P10961	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	HIR1	P32479	840 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	DOM34	P33309	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	MTC2	P34246	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	POA1	P38218	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	TPO1	Q07824	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	FOB1	O13329	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	CDC6	P09119	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	YKL222C	P35995	705 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	BET3	P36149	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSN4	YKL062W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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