RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.41■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.41■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 BIN1O00499 593 aa24.41■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 KAT14Q9H8E8 782 aa24.41■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 PANK2Q9BZ23 570 aa24.41■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 ABCC1P33527 1531 aa24.41■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 RLBP1P12271 317 aa24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 NECAB1Q8N987 351 aa24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 ERLIN1O75477 346 aa24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 LEKR1Q6ZMV7 388 aa24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.39■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.39■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 PDE4BQ07343 736 aa24.39■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.39■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
SMURF1-201ENST00000361125 PIK3C2GO75747 1445 aa24.39■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 GRM8O00222 908 aa24.39■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 TAF4BQ92750 862 aa24.39■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ST5P78524 1137 aa24.39■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 SNX21Q969T3 373 aa24.39■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 BAG3O95817 575 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 PDE1AP54750 535 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 KRT24Q2M2I5 525 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 TSPYL6Q8N831 410 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ISM2Q6H9L7 571 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 KSR2Q6VAB6 950 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 SEC24BO95487 1268 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.38■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 SCLT1Q96NL6 688 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 RAB34Q9BZG1 259 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ATP8B2P98198 1209 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 IQCEQ6IPM2 695 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 WDR62O43379 1518 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 LDHCP07864 332 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 WDR78Q5VTH9 848 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 TMX1Q9H3N1 280 aa24.37■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 SPA17Q15506 151 aa24.36■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.36■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.36■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 BRF1Q92994 677 aa24.36■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 PZPP20742 1482 aa24.36■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 CTAGE5O15320 804 aa24.36■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 KIF5BP33176 963 aa24.36■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 TMX3Q96JJ7 454 aa24.36■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ADAMTS12P58397 1594 aa24.35■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ADCY5O95622 1261 aa24.35■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 MCM5P33992 734 aa24.35■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.35■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD62A6NC57 917 aa24.35■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.35■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 CYP7A1P22680 504 aa24.35■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ATP2B3Q16720 1220 aa24.35■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 LIG1P18858 919 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 SETDB2Q96T68 719 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 CLCN1P35523 988 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 C8orf37Q96NL8 207 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 FLT4P35916 1363 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 NPATQ14207 1427 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 PTPN14Q15678 1187 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 A0A1W2PP64 1363 aa24.34■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 ALDH1L1O75891 902 aa24.33■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.33■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 FEZ1Q99689 392 aa24.33■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
SMURF1-201ENST00000361125 F8W031 263 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
SMURF1-201ENST00000361125 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SMURF1-201ENST00000361125 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.32■■□□□ 1.48
SMURF1-201ENST00000361125 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SMURF1-201ENST00000361125 CASQ1P31415 396 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms