RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W JJJ3P47138 172 aa10.34□□□□□ -0.75
YLR349WYLR349W MFM1Q02783 413 aa10.34□□□□□ -0.75
YLR349WYLR349W ROD1Q02805 837 aa10.34□□□□□ -0.75
YLR349WYLR349W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data10.34□□□□□ -0.75not detected
YLR349WYLR349W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
YLR349WYLR349W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data10.33□□□□□ -0.76not detected
YLR349WYLR349W GSY1P23337 708 aa10.33□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W AVT1P47082 602 aa10.33□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W RAM1P22007 431 aa10.32□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W RSA4P25382 515 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W SEG2P34250 1132 aa10.32□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W SIS2P36024 562 aa10.32□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W CSM3Q04659 317 aa10.32□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W YDR344CQ05510 147 aa10.32□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W COX4P04037 155 aa10.31□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W SPE1P08432 466 aa10.31□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W CIT2P08679 460 aa10.31□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W GLN3P18494 730 aa10.31□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W HEL1P36113 551 aa10.31□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W RIM4P38741 713 aa10.31□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W HXT13P39924 564 aa10.3□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W ESC8Q08119 714 aa10.3□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W TRP2P00899 507 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W TOM70P07213 617 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W SRD1P09007 221 aa10.29□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W FBP26P32604 452 aa10.29□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W BMH2P34730 273 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W RET3P53600 189 aa10.29□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W ZPS1Q12512 249 aa10.29□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W HOP09932 586 aa10.28□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W ATG19P35193 415 aa10.28□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W ERC1P38767 581 aa10.28□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W YEL023CP39992 682 aa10.28□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W ATG32P40458 529 aa10.28□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W PLP2Q12017 286 aa10.28□□□□□ -0.76
YLR349WYLR349W VPS1P21576 704 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W HCM1P25364 564 aa10.27□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W RAD27P26793 382 aa10.27□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W YGL015CP33199 130 aa10.27□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W RPT1P33299 467 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W PGA2P53903 129 aa10.27□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W YNL146WP53906 100 aa10.27□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W TRS120Q04183 1289 aa10.27□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W YML083CQ04526 418 aa10.27□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W SGF29P25554 259 aa10.26□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W BIO2P32451 375 aa10.26□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W VID24P38263 362 aa10.26□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W RPN10P38886 268 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W FYV10P40492 516 aa10.26□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W KRI1P42846 591 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W YLH47Q06493 454 aa10.26□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W LAA1P39526 2014 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W MAS1P10507 462 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W MNR2P35724 969 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W AIM9P40053 627 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W ZAP1P47043 880 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W NUT1P53114 1132 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W RTT102P53330 157 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W NAF1P53919 492 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W GCR2Q01722 534 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W EEB1Q02891 456 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W YDR090CQ03193 310 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W MFB1Q04922 465 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W IES4Q08561 116 aa10.25□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W HIS5P07172 385 aa10.24□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W HMG2P12684 1045 aa10.24□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W THR4P16120 514 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W PDE1P22434 369 aa10.24□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W RPN3P40016 523 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W STB4P50104 949 aa10.24□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W PEX19Q07418 342 aa10.24□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W SLK19Q08581 821 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W CDC6P09119 513 aa10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W TCP1P12612 559 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W DPH2P32461 534 aa10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W RAD54P32863 898 aa10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W STT3P39007 718 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W YER186CP40101 306 aa10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W SPO22P40511 975 aa10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W ARP5P53946 755 aa10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W FMP25Q08023 583 aa10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W REC8Q12188 680 aa10.23□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W HAP2P06774 265 aa10.22□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W PGS1P25578 521 aa10.22□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W HMT1P38074 348 aa10.22□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W MRX3P38172 270 aa10.22□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
YLR349WYLR349W FAA4P47912 694 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 76.8 ms