RNA–Protein interactions for RNA: YLL008W

DRS1, Transcript of Nucleolar DEAD-box protein required for ribosome assembly and function, yeast

Gene DRS1, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRS1	YLL008W	NPY1	P53164	384 aa		7.02	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	ECM9	Q02202	377 aa		7.02	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	HSE1	P38753	452 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	NDE1	P40215	560 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	MNT3	P40549	630 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	UBP15	P50101	1230 aa		7	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	REC104	P33323	182 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	ERR3	P42222	437 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	QRI7	P43122	407 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	SPO74	P45819	413 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	YJR098C	P47139	656 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	MET7	Q08645	548 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	GUP2	Q08929	609 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	YDR056C	Q12025	205 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	CDC4	P07834	779 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	EMC3	P36039	253 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	DID4	P36108	232 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	BNA1	P47096	177 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	TRS130	Q03660	1102 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	ENV7	Q12003	364 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	MIH1	P23748	554 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	YKL151C	P36059	337 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	MSC7	P38694	644 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	MXR1	P40029	184 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	YGR153W	P48238	217 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	VPS30	Q02948	557 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	CIA1	Q05583	330 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	BLI1	P35727	113 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	JNM1	P36224	373 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	DAM1	P53267	343 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	MEC3	Q02574	474 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	PER1	P25625	357 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	VRP1	P37370	817 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	HXT7	P39004	570 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	SRB7	P47822	140 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	SLD3	P53135	668 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DRS1	YLL008W	AFT1	P22149	690 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	BEM3	P32873	1128 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	EMP65	P40085	556 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	ESL1	P40456	1118 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	SKY1	Q03656	742 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	CHS3	P29465	1165 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	IMP2'	P32351	346 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	NEO1	P40527	1151 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	RET2	P43621	546 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	CAF120	P53836	1060 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	HRQ1	Q05549	1077 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	MED1	Q12321	566 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	ATG14	P38270	344 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	GUP1	P53154	560 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	PEX15	Q08215	383 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	ENA1	P13587	1091 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	ASH1	P34233	588 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	ENA2	Q01896	1091 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	ENA5	Q12691	1091 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	YAR028W	P39548	234 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	IML2	P47031	731 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	TAD1	P53065	400 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	MEP3	P53390	489 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	GTR1	Q00582	310 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	NHX1	Q04121	633 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	YPL260W	Q08977	551 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	YOL114C	Q12322	202 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	MSM1	P22438	575 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	HXT16	P47185	567 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	GCV1	P48015	400 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	YDR514C	Q04408	483 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	OPY2	Q06810	360 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	PHO81	P17442	1178 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	YKU70	P32807	602 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	CAB3	P36076	571 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
DRS1	YLL008W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.1 ms