RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564601.5

RNPS1-210, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene RNPS1, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-210ENST00000564601 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.39■■□□□ 1.66
RNPS1-210ENST00000564601 TTLL6Q8N841 843 aa25.39■■□□□ 1.66
RNPS1-210ENST00000564601 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.39■■□□□ 1.66
RNPS1-210ENST00000564601 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-210ENST00000564601 H0YIN7 160 aa25.37■■□□□ 1.65
RNPS1-210ENST00000564601 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RNPS1-210ENST00000564601 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
RNPS1-210ENST00000564601 CNBD1Q8NA66 436 aa25.35■■□□□ 1.65
RNPS1-210ENST00000564601 SETDB2Q96T68 719 aa25.35■■□□□ 1.65
RNPS1-210ENST00000564601 HLFQ16534 295 aa25.34■■□□□ 1.65
RNPS1-210ENST00000564601 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.34■■□□□ 1.65
RNPS1-210ENST00000564601 PDE6BP35913 854 aa25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-210ENST00000564601 RGL2O15211 777 aa25.32■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 SRGNP10124 158 aa25.32■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 LMNB1P20700 586 aa25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 RIPK4P57078 832 aa25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 ABCC12Q96J65 1359 aa25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 C21orf2O43822 256 aa25.29■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.29■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 ST5P78524 1137 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 STYK1Q6J9G0 422 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 SNED1Q8TER0 1413 aa25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-210ENST00000564601 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 HTRA3P83110 453 aa25.25■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 RRAGCQ9HB90 399 aa25.25■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.25■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.25■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.25■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 PDIA6Q15084 440 aa25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 RUNDC1Q96C34 613 aa25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 MASTLQ96GX5 879 aa25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 FSTL1Q12841 308 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 KLRG1Q96E93 195 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 GLTPD2A6NH11 291 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 POTECB2RU33 542 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 NGEFQ8N5V2 710 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 CNKSR1Q969H4 720 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 FAM177BA6PVY3 158 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 MYL6BP14649 208 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 PROSER3Q2NL68 480 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 JMYQ8N9B5 988 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
RNPS1-210ENST00000564601 ERBB4Q15303 1308 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 NPHP1O15259 732 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 NEUROD2Q15784 382 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 OLFM4Q6UX06 510 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 LAMB2P55268 1798 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 SLC51AQ86UW1 340 aa25.19■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 PCNTO95613 3336 aa25.19■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 NPR1P16066 1061 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 CRY2Q49AN0 593 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 COL4A5P29400 1685 aa25.17■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 ANXA1P04083 346 aa25.17■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 KRT24Q2M2I5 525 aa25.17■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.17■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 ERFEQ4G0M1 354 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 NTSR2O95665 410 aa25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 GPTP24298 496 aa25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 SUSD4Q5VX71 490 aa25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 CHL1O00533 1208 aa25.14■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.14■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.14■■□□□ 1.62
RNPS1-210ENST00000564601 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-210ENST00000564601 CCDC93Q567U6 631 aa25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-210ENST00000564601 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-210ENST00000564601 SOGA3Q5TF21 947 aa25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-210ENST00000564601 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-210ENST00000564601 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms