RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFV2P19404 249 aa6.08□□□□□ -1.44
ECHDC1-211ENST00000460558 RGS19P49795 217 aa6.08□□□□□ -1.44
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ECHDC1-211ENST00000460558 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.08□□□□□ -1.44
ECHDC1-211ENST00000460558 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.08□□□□□ -1.44
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ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.04□□□□□ -1.44
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ECHDC1-211ENST00000460558 PBX2P40425 430 aa6.03□□□□□ -1.44
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ECHDC1-211ENST00000460558 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.03□□□□□ -1.44
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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ECHDC1-211ENST00000460558 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.02□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 LBX1P52954 281 aa6.02□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.02□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 NLRP13Q86W25 1043 aa6.02□□□□□ -1.45
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ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.02□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC7Q96M83 1385 aa6.02□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.02□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 AP1G2O75843 785 aa6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.01□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNQ4P56696 695 aa6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 IRF5Q13568 498 aa6□□□□□ -1.45
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