RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.24■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 STX6O43752 255 aa20.23■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.23■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.23■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.22■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 F13A1P00488 732 aa20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 SOX12O15370 315 aa20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 EVI5LQ96CN4 794 aa20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.2■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 NUTM2FA1L443 756 aa20.2■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 AK2P54819 239 aa20.2■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.2■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.2■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.2■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 MRC1P22897 1456 aa20.2■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 PDCP20941 246 aa20.19■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 ADCY9O60503 1353 aa20.19■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 UTYO14607 1347 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 ELP1O95163 1332 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 TCHHQ07283 1943 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 SYT1P21579 422 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 PSMA5P28066 241 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD1Q15327 319 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 RUFY3Q7L099 469 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 ABTB2Q8N961 1025 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 HYPKQ9NX55 129 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.18■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 USP25Q9UHP3 1055 aa20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 SLIT3O75094 1523 aa20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 ABCC6O95255 1503 aa20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 TICAM2Q86XR7 235 aa20.16■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 TEFQ10587 303 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 IL25Q9H293 177 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 JCADQ9P266 1359 aa20.15■□□□□ 0.82
HCLS1-202ENST00000428394 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 UQCRHP07919 91 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 RNF20Q5VTR2 975 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 KSR2Q6VAB6 950 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 NECTIN1Q15223 517 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 RASEFQ8IZ41 740 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 RNF214Q8ND24 703 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.13■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 NECTIN2Q92692 538 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 MTMR6Q9Y217 621 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 KDM4AO75164 1064 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 LINS1Q8NG48 757 aa20.12■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 COL15A1P39059 1388 aa20.11■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 BTBD11A6QL63 1104 aa20.11■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 TOM1O60784 492 aa20.11■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 KCNA6P17658 529 aa20.11■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.11■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 MAP4K1Q92918 833 aa20.11■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 CAVIN2O95810 425 aa20.1■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC192P0DO97 292 aa20.1■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 GJB2P29033 226 aa20.1■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.1■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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