RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC93Q567U6 631 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 MST1RQ04912 1400 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRB2O60241 1585 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 IQCA1LA6NCM1 817 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CHMP4BP1P59074 171 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 FAM89AQ96GI7 184 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 JAG2Q9Y219 1238 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 IGSF1Q8N6C5 1336 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CYP27B1O15528 508 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 RAD17O75943 681 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 DPEP1P16444 411 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 PARP10Q53GL7 1025 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CDCA7LQ96GN5 454 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 FEZ1Q99689 392 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SURF6O75683 361 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 USP16Q9Y5T5 823 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 PLSCR1O15162 318 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SSFA2P28290 1259 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 PI4KAP2A4QPH2 592 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 IL13P35225 146 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 TNIP1Q15025 636 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 DOK7Q18PE1 504 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC158Q5M9N0 1113 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 STK11IPQ8N1F8 1099 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 GGA1Q9UJY5 639 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 DCCP43146 1447 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SSH2Q76I76 1423 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP8Q14318 412 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC136Q96JN2 1154 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 IQSEC2Q5JU85 1478 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 NALCNQ8IZF0 1738 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 E9PSI1 815 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CASC1Q6TDU7 716 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ITSN1Q15811 1721 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CLSTN1O94985 981 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ADRA2BP18089 450 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RRAGCQ9HB90 399 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 NWD1Q149M9 1564 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TTC39AQ5SRH9 613 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ATG3Q9NT62 314 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 USP31Q70CQ4 1352 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 STRCQ7RTU9 1775 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 FMN2Q9NZ56 1722 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RTKN2Q8IZC4 609 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 INSRP06213 1382 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 F6X3S4 739 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 GNAI3P08754 354 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 DLGAP5Q15398 846 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 WWC1Q8IX03 1113 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf69Q8N8R5 385 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 DNAAF4Q8WXU2 420 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 MASTLQ96GX5 879 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 IDH1O75874 414 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TNNI2P48788 182 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF6Q15052 776 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K5Q99683 1374 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 KIF22Q14807 665 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
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