RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 NUP62CLQ9H1M0 184 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CRB1P82279 1406 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 DDIT3P35638 169 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 LINS1Q8NG48 757 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 SGSM2O43147 1006 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 GJB2P29033 226 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K11Q16584 847 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 USP48Q86UV5 1035 aa10.5□□□□□ -0.73
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HERC3-201ENST00000264345 TNMDQ9H2S6 317 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 OFD1O75665 1012 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 F13A1P00488 732 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD24Q8TF21 1146 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 SPATA32Q96LK8 384 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 RNMTO43148 476 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CABP4P57796 275 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 GRM8O00222 908 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CAVIN2O95810 425 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CUL4AQ13619 759 aa10.49□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 TM6SF1Q9BZW5 370 aa10.48□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
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HERC3-201ENST00000264345 DIP2BQ9P265 1576 aa10.48□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 IL17REQ8NFR9 667 aa10.48□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 NEUROD6Q96NK8 337 aa10.48□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.48□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CTNNA3Q9UI47 895 aa10.48□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 SIL1Q9H173 461 aa10.48□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 MYO5BQ9ULV0 1848 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 UQCRHLA0A096LP55 91 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 UQCRHP07919 91 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 KCNA6P17658 529 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 AK2P54819 239 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 RBSNQ9H1K0 784 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 SNX14Q9Y5W7 946 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 TRDNQ13061 729 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 ARID3AQ99856 593 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 ATP10DQ9P241 1426 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 KDRP35968 1356 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CPLX1O14810 134 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CTAGE5O15320 804 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 MYL6BP14649 208 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CCDC158Q5M9N0 1113 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 FMNL2Q96PY5 1086 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 MYD88Q99836 296 aa10.47□□□□□ -0.73
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HERC3-201ENST00000264345 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.46□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 KINO60870 393 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 POLA2Q14181 598 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 NCAPD2Q15021 1401 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 TRIM5Q9C035 493 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 PDCL3Q9H2J4 239 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 BEND3Q5T5X7 828 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CCDC171Q6TFL3 1326 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 DYNC1I1O14576 645 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 GAS2L3Q86XJ1 694 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 TRIM29Q14134 588 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CNPY2Q9Y2B0 182 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 DIP2AQ14689 1571 aa10.45□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ADCY5O95622 1261 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 TTC39AQ5SRH9 613 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 NRKQ7Z2Y5 1582 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 AKAP2Q9Y2D5 859 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 SYT1P21579 422 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 KIF6Q6ZMV9 814 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 NEK1Q96PY6 1258 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.43□□□□□ -0.74
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