RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zap70P43404 618 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc146E9Q9F7 977 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MpndQ3TV65 487 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp8b2P98199 1209 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nek4Q9Z1J2 792 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HellsQ60848 821 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atg4aQ8C9S8 396 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nphp1Q9QY53 687 aa28.51■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MypnQ5DTJ9 1315 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smarcc1P97496 1104 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q8BT18 775 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mmp8O70138 465 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vars2Q3U2A8 1060 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Srgap3Q812A2 1099 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Htatsf1Q8BGC0 757 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slfnl1Q8BHW9 410 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm13023A2A8N2 498 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Map3k13Q1HKZ5 959 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Snapc4Q8BP86 1333 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ddx58Q6Q899 926 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prr5lA2AVJ5 370 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ankrd13dQ6PD24 605 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ddx60E9PZQ1 1711 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mcmdc2E9Q956 681 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp6r3Q922D4 844 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Terf2O35144 541 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fkbp5Q64378 456 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AK157302I3ITR1 129 aa28.39■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pim2Q62070 370 aa28.39■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Isca1Q9D924 129 aa28.39■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zkscan2G3X952 960 aa28.39■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ArxO35085 564 aa28.39■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Grm8P47743 908 aa28.39■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cwc27Q3TKY6 469 aa28.39■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ripor2Q80U16 1078 aa28.39■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ssc5dQ8BV57 1371 aa28.38■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adam1aQ60813 791 aa28.38■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa28.38■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prr29B1ARI9 187 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 C4bP01029 1738 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ank1Q02357 1862 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Strn4P58404 760 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NmiO35309 314 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrrc43Q3V0L5 667 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Esco1Q69Z69 843 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AbraQ8BUZ1 375 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tlr7P58681 1050 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trip6Q9Z1Y4 480 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ier5O89113 308 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Soga3Q6NZL0 945 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rnf123Q5XPI3 1314 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pdlim2Q8R1G6 349 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myd88P22366 296 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Catsper2A2ARP9 588 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mum1Q6DID5 682 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rgs17Q9QZB0 210 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cwc25Q9DBF7 416 aa28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bcar3Q9QZK2 820 aa28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slf2Q6P9P0 1278 aa28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GorabQ8BRM2 368 aa28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ehd4Q9EQP2 541 aa28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa28.3■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stard3nlQ9DCI3 235 aa28.3■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mrc1Q61830 1456 aa28.3■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dpf1Q9QX66 387 aa28.29■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc6D3YZP9 469 aa28.28■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp1b3P97370 278 aa28.28■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 DaxxO35613 739 aa28.27■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tgfb1i1Q62219 461 aa28.27■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q9D2X8 372 aa28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.8 ms