RNA–Protein interactions for RNA: YPR049C

ATG11, Transcript of Adapter protein for pexophagy and the Cvt targeting pathway, yeast

Gene ATG11, Length 3,537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG11	YPR049C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	MET7	Q08645	548 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	ERP5	P38819	212 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	THI3	Q07471	609 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	COQ4	O13525	335 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	ARP1	P38696	384 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	TED1	P40533	473 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	CUZ1	P53899	274 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	RGP1	P16664	663 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	MCM7	P38132	845 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	GIP1	P38229	639 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	GUD1	Q07729	489 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	YLL054C	Q12244	843 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	MRPL33	P20084	86 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	EUG1	P32474	517 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	ITC1	P53125	1264 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	FAR11	P53917	953 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	YMR187C	Q03236	431 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	YPR117W	Q06116	2489 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	IDI1	P15496	288 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	VMA3	P25515	160 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	ASF1	P32447	279 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	YFH7	P43591	353 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	APL6	P46682	809 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	NHA1	Q99271	985 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ATG11	YPR049C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	DIT1	P21623	536 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	RSC6	P25632	483 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	YBR197C	P38306	217 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	JHD1	P40034	492 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	DAL4	Q04895	635 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	YPR084W	Q06821	456 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	CYB2	P00175	591 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	ADP1	P25371	1049 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
ATG11	YPR049C	ACA1	P39970	489 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	PSH1	Q12161	406 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	DYN1	P36022	4092 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	RIM4	P38741	713 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	YOR131C	Q12486	218 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	TGL1	P34163	548 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	MRL1	Q06815	381 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	PES4	P39684	611 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	HEH2	Q03281	663 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	HUL4	P40985	892 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	MCM1	P11746	286 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	MBR1	P23493	339 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	PEP12	P32854	288 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	RRM3	P38766	723 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	YJR107W	P47145	328 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	YGR125W	P53273	1036 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	YAF9	P53930	226 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	SKY1	Q03656	742 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	HPF1	Q05164	967 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	CCH1	P50077	2039 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	HIP1	P06775	603 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	POX1	P13711	748 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	MRPS18	P42847	217 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	ATG1	P53104	897 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	IRC10	Q08118	586 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	LAP2	Q10740	671 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	LAA1	P39526	2014 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	URK1	P27515	501 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	APM2	P38700	605 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	PSY2	P40164	858 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	TPO2	P53283	614 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	YUR1	P26725	428 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	VID30	P53076	958 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	BSC2	Q05611	235 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	PRD1	P25375	712 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ATG11	YPR049C	TRK2	P28584	889 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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