RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	CDC16	P09798	840 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YHL050C	P38721	697 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YHR219W	P38900	624 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YGL242C	P53066	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	IRC4	Q03036	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	GSC2	P40989	1895 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	FLP1	P03870	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	RRM3	P38766	723 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	TED1	P40533	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YIR042C	P40586	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YJR124C	P47159	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	MRPS35	P53292	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	DSE4	P53753	1117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	NCB2	Q92317	146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YKU70	P32807	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	RIM11	P38615	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	PAN5	P38787	379 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	GSM1	P42950	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	SAM37	P50110	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	MLC1	P53141	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	GRX6	Q12438	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	FLO1	P32768	1537 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	SAC7	P17121	654 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	SEC20	P28791	383 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	TAT1	P38085	619 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	PRY1	P47032	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	INM2	Q05533	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	RRI2	Q12348	645 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	RAD50	P12753	1312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	STV1	P37296	890 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	BRN1	P38170	754 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	FET4	P40988	552 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	LSB6	P42951	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	HXT17	P53631	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	DUR3	P33413	735 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	GRX7	P38068	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	SHC1	P39000	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	SNF3	P10870	884 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	NPR1	P22211	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	AFG2	P32794	780 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	VPS35	P34110	944 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	YHL008C	P38750	627 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	HXT13	P39924	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	NUT1	P53114	1132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	UBX2	Q04228	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	RIM20	Q12033	661 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	LAM4	P38800	1345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	RSC6	P25632	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	SLD2	P34252	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	PBY1	P38254	753 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	NEO1	P40527	1151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	YFH7	P43591	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	VPS4	P52917	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	PMT7	Q06644	662 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	PIF1	P07271	859 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	MET4	P32389	672 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	YIG1	Q08956	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	ELG1	Q12050	791 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	MCA1	Q08601	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	WHI5	Q12416	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPQ1	YPL179W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.53	□□□□□ -1.69

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