RNA–Protein interactions for RNA: YOR011W

AUS1, Transcript of Plasma membrane sterol transporter of the ATP-binding cassette family, yeast

Gene AUS1, Length 4,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AUS1	YOR011W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	STR2	P47164	639 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YNL144C	P53907	740 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	IRC4	Q03036	179 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	URH1	Q04179	340 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	RAD57	P25301	460 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SEG2	P34250	1132 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	KAP114	P53067	1004 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	VID30	P53076	958 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YGR021W	P53212	290 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	GTR1	Q00582	310 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ECM23	Q02710	187 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ACE2	P21192	770 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	KRE2	P27809	442 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ECM1	P39715	212 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	EFM4	P40516	257 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	MFM1	Q02783	413 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	MLH2	Q07980	695 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	DSE3	Q08729	430 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	TAF10	Q12030	206 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	KAR3	P17119	729 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	MSH1	P25846	959 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	TFC4	P33339	1025 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ATG19	P35193	415 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	MYO3	P36006	1272 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	PET10	P36139	283 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	TDA3	P38758	523 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	MDM1	Q01846	1127 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	AAD16	Q02895	342 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SDH5	Q08230	162 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	CCL1	P37366	393 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	HOS4	P40480	1083 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	LSC2	P53312	427 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SPC24	Q04477	213 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	CRF1	Q04930	467 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YLR001C	Q07895	862 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ARG82	P07250	355 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	CHS2	P14180	963 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SIT4	P20604	311 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YME1	P32795	747 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ISW1	P38144	1129 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YSW1	P38280	609 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YJR079W	P47126	109 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	HOP2	P53187	214 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	PCL8	Q08966	492 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	PTC5	Q12511	572 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
AUS1	YOR011W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SWE1	P32944	819 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	CST26	P38226	397 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	PFF1	P38244	976 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	FZO1	P38297	855 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	BOP3	P53958	396 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YML119W	Q03208	357 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	MSH6	Q03834	1242 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	AIM41	Q12032	185 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	MIP1	P15801	1254 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ROG3	P43602	733 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ECI1	Q05871	280 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	HIF1	Q12373	385 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SEC39	Q12745	709 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	ADH4	P10127	382 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
AUS1	YOR011W	PRE8	P23639	250 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	SWI3	P32591	825 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YKL050C	P35736	922 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	YBL028C	P38202	106 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AUS1	YOR011W	MED8	P38304	223 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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