RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	CSI1	Q04368	295 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	COG8	Q04632	607 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	HDA2	Q06629	674 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	CDC16	P09798	840 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	YKL069W	P36088	180 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	TAT2	P38967	592 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	ENT3	P47160	408 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	TYW3	P53177	273 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	SPO1	P53541	631 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	SIW14	P53965	281 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	CTF4	Q01454	927 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	FKS3	Q04952	1785 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	LYP1	P32487	611 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	ATG14	P38270	344 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	BUD6	P41697	788 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	GNP1	P48813	663 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	YMR074C	Q04773	145 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	SPO75	Q07798	868 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	OSH2	Q12451	1283 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	BDH2	P39713	417 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	LSB6	P42951	607 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	AOS1	Q06624	347 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	LYS2	P07702	1392 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	COQ4	O13525	335 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.56	□□□□□ -1.36	RIP-Chip
PSH1	YOL054W	AGP1	P25376	633 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	MRP8	P35719	219 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	TFA2	P36145	328 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	EXO5	P38289	585 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	MSC7	P38694	644 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	PRK1	P40494	810 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	NEO1	P40527	1151 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	SOG2	Q08817	791 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	HVG1	P0CE11	249 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	RER2	P35196	286 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	NUP82	P40368	713 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	YGR125W	P53273	1036 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	YNR065C	P53751	1116 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	CUZ1	P53899	274 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	LCD1	Q04377	747 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	GAL11	P19659	1081 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	RDH54	P38086	958 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	YBR184W	P38299	523 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	LEM3	P42838	414 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	GUP1	P53154	560 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	HST1	P53685	503 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	FAR11	P53917	953 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	ROD1	Q02805	837 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	SHE9	Q04172	456 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	YOL057W	Q08225	711 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	FLC1	Q08967	793 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	YLR125W	Q12138	136 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	PHO8	P11491	566 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	RAD24	P32641	659 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	CEM1	P39525	442 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	HXT13	P39924	564 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	CIR1	P42940	261 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	NPA3	P47122	385 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	HXT17	P53631	564 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	NSG2	P53898	299 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	HXT15	P54854	567 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	EST2	Q06163	884 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	REC8	Q12188	680 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PSH1	YOL054W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	TIM23	P32897	222 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PSH1	YOL054W	ADD66	P36040	267 aa		6.52	□□□□□ -1.37

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