RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YNL193W	P53870	558 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	GIC2	Q06648	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	NNK1	P36003	928 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	RRM3	P38766	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	TOK1	P40310	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	TGL2	P54857	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	ACM1	Q08981	209 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	SPO21	Q12411	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	SFA1	P32771	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YSC84	P32793	468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	PEX6	P33760	1030 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	GIC1	P38785	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	GEM1	P39722	662 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	TFB2	Q02939	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	LAP2	Q10740	671 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	ADR1	P07248	1323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	CDC9	P04819	755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YEN1	P40028	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	LCD1	Q04377	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	ENV7	Q12003	364 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	BI4	P03879	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	SRM1	P21827	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	CDC11	P32458	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	SRD1	P09007	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	ACE2	P21192	770 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
DSS1	YMR287C	ATP25	Q03153	612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	MDM38	Q08179	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	MCD4	P36051	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YVC1	Q12324	675 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YJR120W	P47157	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	CAF16	P43569	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	SRT1	Q03175	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	NFS1	P25374	497 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	VBA3	P25594	458 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	PEX7	P39108	375 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	ALG2	P43636	503 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	YJR008W	P47085	338 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	GYP7	P48365	746 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	XYL2	Q07993	356 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	PEX8	P53248	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	FOL1	P53848	824 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	THI73	Q07904	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	MET13	P53128	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	FBP1	P09201	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	PRO1	P32264	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	YEL1	P34225	687 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	COG6	P53959	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	RSC3	Q06639	885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	REC104	P33323	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	TDA6	Q06466	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	DOM34	P33309	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	EMC3	P36039	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	HSE1	P38753	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	SKN7	P38889	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	GPR1	Q12361	961 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	RAD53	P22216	821 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	MRC1	P25588	1096 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	RRT14	P40470	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	HFM1	P51979	1187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	SFB2	P53953	876 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	PIK1	P39104	1066 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	YGR237C	P50089	785 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	UME1	Q03010	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	TPP1	Q03796	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.9 ms