RNA–Protein interactions for RNA: YLL042C

ATG10, Transcript of Conserved E2-like conjugating enzyme, yeast

Gene ATG10, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG10	YLL042C	EAF1	Q06337	982 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG10	YLL042C	CYC7	P00045	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	CCZ1	P38273	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	PTC7	P38797	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	GTS1	P40956	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	RTA1	P53047	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	BI4	P03879	638 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	CAN1	P04817	590 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	ARE1	P25628	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	TIM23	P32897	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	AFR1	P33304	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	BET3	P36149	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	MTC3	P53077	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	SDH1	Q00711	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
ATG10	YLL042C	ATG13	Q06628	738 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	MED7	Q08278	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	GAL11	P19659	1081 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	TOS1	P38288	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	NPP2	P39997	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	NUP82	P40368	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	RNH70	P53331	553 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	TOP3	P13099	656 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	NPP1	P25353	742 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	ERT1	P38140	529 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	GIC1	P38785	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	CCC2	P38995	1004 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	SIT1	P39980	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	CTH1	P47976	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
ATG10	YLL042C	MDM38	Q08179	573 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	NSI1	Q12457	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	ACE2	P21192	770 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	ADP1	P25371	1049 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	AIM26	P32858	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	YBR284W	P38150	797 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	HFM1	P51979	1187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	ORC3	P54790	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	AIM44	Q99299	758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	PPH3	P32345	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
ATG10	YLL042C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	PET10	P36139	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	RRT14	P40470	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	HUL4	P40985	892 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	OSW7	P43611	510 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	ALG12	P53730	551 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	XYL2	Q07993	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	RSB1	Q08417	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	SVS1	Q12254	260 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG10	YLL042C	SPS1	P08458	490 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	PHO8	P11491	566 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	YRO2	P38079	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	GYP7	P48365	746 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	INP52	P50942	1183 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	TPO2	P53283	614 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
ATG10	YLL042C	SRT1	Q03175	343 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	CDC11	P32458	415 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	HSP78	P33416	811 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	TOK1	P40310	691 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	MAL11	P53048	616 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	ADE8	P04161	214 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	FUN30	P31380	1131 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	MAC1	P35192	417 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	YKE2	P52553	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	SFB2	P53953	876 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	LCD1	Q04377	747 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG10	YLL042C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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