RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	SNO2	P53823	222 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	MRPL22	P53881	309 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	SLA2	P33338	968 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	IRR1	P40541	1150 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	PBY1	P38254	753 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	RRT14	P40470	206 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	TPO2	P53283	614 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	CMP2	P14747	604 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	PPH3	P32345	308 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	YBR184W	P38299	523 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	ATG13	Q06628	738 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	YDR306C	Q06640	478 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	SPO75	Q07798	868 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	ACE2	P21192	770 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	OSW2	Q12202	724 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	RNQ1	P25367	405 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	NIT1	P40447	199 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	SGD1	Q06132	899 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.62	□□□□□ -1.51	not detected
YKR070W	YKR070W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	IRC24	P40580	263 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	NNF1	P47149	201 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	ROT1	Q03691	256 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	OSH2	Q12451	1283 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	RAD4	P14736	754 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	ELM1	P32801	640 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	STE5	P32917	917 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	TIM54	P47045	478 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	YJL049W	P47048	450 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	HFM1	P51979	1187 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	EAF1	Q06337	982 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	MDM38	Q08179	573 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	ADE8	P04161	214 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	GAL10	P04397	699 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	ENA1	P13587	1091 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	ARE1	P25628	610 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	ALR2	P43553	858 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	YLL058W	Q12198	575 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YKR070W	YKR070W	CDC11	P32458	415 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	SCT1	P32784	759 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	YKL151C	P36059	337 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	LAM1	P38851	1228 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	ERP6	P53198	216 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	YPR196W	Q06595	470 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	CDA2	Q06703	312 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	YRO2	P38079	344 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.57	□□□□□ -1.52	not detected
YKR070W	YKR070W	YGR125W	P53273	1036 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	SRT1	Q03175	343 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	MSC2	Q03455	724 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	FMP25	Q08023	583 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	MEF2	P39677	819 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	UBP5	P39944	805 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	SPT20	P50875	604 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	MTC3	P53077	123 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	SIZ1	Q04195	904 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	FUN30	P31380	1131 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	YAP1801	P38856	637 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	CCC2	P38995	1004 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	ZRG8	P40021	1076 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	PFD1	P46988	109 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	RIM8	P53179	542 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	UBX5	Q06682	500 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	YPL277C	Q08989	487 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	SOD2	P00447	233 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	SRM1	P21827	482 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	TOD6	P34219	525 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	GIC1	P38785	314 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	HUL4	P40985	892 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	GCN5	Q03330	439 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	PLB2	Q03674	706 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	RXT3	Q07458	294 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	XYL2	Q07993	356 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	YOR131C	Q12486	218 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.4 ms