RNA–Protein interactions for RNA: YKL007W

CAP1, Transcript of Alpha subunit of the capping protein heterodimer (Cap1p and Cap2p), yeast

Gene CAP1, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CAP1	YKL007W	MRP8	P35719	219 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CAP1	YKL007W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CAP1	YKL007W	RIM8	P53179	542 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CAP1	YKL007W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CAP1	YKL007W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	SOD2	P00447	233 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	BI4	P03879	638 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
CAP1	YKL007W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	VBA5	P36172	582 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	LAM1	P38851	1228 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	SIZ1	Q04195	904 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	ESC2	Q06340	456 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	CMP2	P14747	604 aa		5	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	PRI2	P20457	528 aa		5	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	PBY1	P38254	753 aa		5	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	OSW2	Q12202	724 aa		5	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	MEF2	P39677	819 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	IRR1	P40541	1150 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	TPO2	P53283	614 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	MSC2	Q03455	724 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	GAL10	P04397	699 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	MBP1	P39678	833 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	GCN5	Q03330	439 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	FUN30	P31380	1131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	YKL069W	P36088	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	HFM1	P51979	1187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	MTC3	P53077	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	RXT3	Q07458	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	MDM38	Q08179	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
CAP1	YKL007W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CAP1	YKL007W	YLR358C	O13565	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	SRM1	P21827	482 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	DOM34	P33309	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	THI80	P35202	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	YKL151C	P36059	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	YJL049W	P47048	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	SPT20	P50875	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	ROT1	Q03691	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	SPO75	Q07798	868 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	ADE8	P04161	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	RPC82	P32349	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	TOD6	P34219	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	YAP1801	P38856	637 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
CAP1	YKL007W	SRT1	Q03175	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	GPB1	Q08886	897 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
CAP1	YKL007W	PPH3	P32345	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	PLB2	Q03674	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	DUS4	Q06063	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	CDC11	P32458	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	YBR184W	P38299	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	MND2	P40577	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	GYP7	P48365	746 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	ENA1	P13587	1091 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	POA1	P38218	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	GIC1	P38785	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	SIT1	P39980	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	ESC8	Q08119	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	HSF1	P10961	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	STE5	P32917	917 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	NNF1	P47149	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	ERP6	P53198	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	YGR012W	P53206	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	XYL2	Q07993	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	FMP25	Q08023	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAP1	YKL007W	CDC20	P26309	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAP1	YKL007W	ATG19	P35193	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAP1	YKL007W	CCC2	P38995	1004 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAP1	YKL007W	YER158C	P40095	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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